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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 16核cpu和vasp的不兼容情况
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bigcontinent

金虫 (正式写手)

[交流] 16核cpu和vasp的不兼容情况

用vasp好几年了，以前都是用12核的机器，一切都好没有任何问题，但是最近买了几台16核的机器发现了一个严重问题。在16核上编译vasp5.3和vasp5.4可以正常编译通过，但是在计算极化体系的时候（spin=2）就会在第一步自洽的时候出错，错误提示如下：
WARNING in EDDIAG: sub space matrix is not hermitian    1     0.176E+14
或者
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!         117           1           2
首先我可以肯定的是输入文件没有任何问题，因为在12核机器上（也是同样版本的5.3和5.4）是正常计算的。然后我就在网上找了各种可能的解决方案，总的来说通过input中修改关键字的方法我都试过了，但是没有用。以上错误只是出现在spin=2的时候（我算的是一个含Cu的有机体系），如果计算spin=1的体系，就没有任何问题。
不知道大家有没有遇到过类似的问题，有没有解决的办法。

PS：12核和16核的cpu都是intel的，编译的时候intel的MKL和单独的lapack以及fftw3d都试过了
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1楼 2016-03-01 09:22:18
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syhorchid
★
bigcontinent(金币+1): 谢谢参与
2楼2016-03-01 09:25:52
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宝贝乖乖快来
祝福
3楼2016-03-01 09:33:45
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wanghaogea

铁虫 (文坛精英)
帮顶
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future is glorious
4楼2016-03-01 09:41:13
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xhmaohan
5楼2016-03-01 09:56:06
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hakuna

木虫 (知名作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
与核心数没关系吧，以前遇到过这种问题，印象中微调一下结构就OK了，现在用的机器就是16核心的，没有遇到这种问题
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6楼2016-03-01 16:26:01
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bigcontinent

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hakuna at 2016-03-01 16:26:01
与核心数没关系吧，以前遇到过这种问题，印象中微调一下结构就OK了，现在用的机器就是16核心的，没有遇到这种问题

结构肯定是合理的，是12核机器做过的optimized结构。你做的体系也是spin=2的吗,一切正常？
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7楼2016-03-01 16:31:46
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hakuna

木虫 (知名作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by bigcontinent at 2016-03-01 16:31:46
结构肯定是合理的，是12核机器做过的optimized结构。你做的体系也是spin=2的吗,一切正常？...

我没说你结构不合理，只是想告诉你怎么解决问题。你的问题属于数值计算中的问题，因为计算过程太复杂，电脑计算都是近似的，很难搞清楚什么原因引起的....
考虑自旋极化是个很常规的计算，16核心机器上算得多了，没问题
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8楼2016-03-01 16:41:34
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bigcontinent

金虫 (正式写手)
如果是结构的问题，那只能说16核机器上编译后的vasp有些问题，因为同样的结构在12核上用同样的程序计算就是正常的
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9楼2016-03-01 22:14:25
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bluewhale

铁杆木虫 (正式写手)
OS 一样吗？
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10楼2016-03-02 15:57:53
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