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baierlug

铜虫 (小有名气)

[求助] Blast的E value怎么算的大小 已有1人参与

1.比如E value值是3e-17,这代表什么?我想用计算器算出来大小。

2.另外“query cover的意思是用于计算得分值的序列占你的序列总长度的百分比,比如你的序列总共100bp,参与比对打分的区域有80bp(就是比对结果里你的序列参与比对的区域),那query cover就是80%。”这句话正确吗?

谢谢!
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嬉皮之下尽是忧伤
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大猩猩

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

小木虫越来越萧条了啊,16年的帖子到现在没人回。原因当然也在于很多老鸟也都归隐了,而现在检索资源越来越容易了,新鸟们只要稍微耐心检索下应该都能自行获得答案(就像这个帖子的提问一样,太简单了以至于没人愿意费神搭理)。

我来吧
1、3e-17就是3×10^(-15)的意思
2、cover的意思应该不是自身比较,是你的序列和比对上的序列之间的匹配长度占比
2楼2020-03-14 11:35:54
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