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baierlug

铜虫 (小有名气)

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[求助] Blast的E value怎么算的大小已有1人参与

1.比如E value值是3e-17，这代表什么？我想用计算器算出来大小。

2.另外“query cover的意思是用于计算得分值的序列占你的序列总长度的百分比，比如你的序列总共100bp，参与比对打分的区域有80bp（就是比对结果里你的序列参与比对的区域），那query cover就是80%。”这句话正确吗？

谢谢！

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嬉皮之下尽是忧伤

1楼 2016-02-26 13:05:09

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大猩猩

木虫 (小有名气)

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专业: 生物大分子结构与功能

【答案】应助回帖

小木虫越来越萧条了啊，16年的帖子到现在没人回。原因当然也在于很多老鸟也都归隐了，而现在检索资源越来越容易了，新鸟们只要稍微耐心检索下应该都能自行获得答案（就像这个帖子的提问一样，太简单了以至于没人愿意费神搭理）。

我来吧
1、3e-17就是3×10^(-15)的意思
2、cover的意思应该不是自身比较，是你的序列和比对上的序列之间的匹配长度占比

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