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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 如何得知某种蛋白质的解离常数PKa的值？
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安蓉

木虫 (正式写手)

[交流] 如何得知某种蛋白质的解离常数PKa的值？

请问大侠们，如何得知某种蛋白质的解离常数PKa的值？这个PKa值是固定不变的吗？如何得知在某PH条件下，蛋白质中性分子占百分之多少呢？急求，谢谢大家。
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1楼 2013-10-14 21:07:05
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hl16010921

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
安蓉: 金币+4 2013-10-18 09:00:39
silicare: BioEPI+1, 应助指数+1, 最佳答案 2014-02-28 16:50:02
pKa一般是某一基团的解离常数，一般为酸性基团，例如磷酸有pKa1，pKa2和pKa3.对特定分子的pKa是固定的（水溶液，稀溶液）所以蛋白的pKa没啥意义吧，一般只有等电点，有些可以查到，有些可以用等点聚焦测出。至于某pH值下的缓冲体系中，所有同种蛋白的带电情况是相同的，不存在中性分子比例问题。而非缓冲体系的pH值一般是不稳定的，条件不足以推出该蛋白的中性蛋白比例。
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6楼2013-10-17 08:29:20
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
安蓉: 金币+1 2013-10-19 09:45:14
引用回帖:
13楼: Originally posted by 安蓉 at 2013-10-18 18:51:37
啥时候发过来啊，牛人...

ACD_labs软件可以
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15楼2013-10-18 22:18:13
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安蓉

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yingying1588 at 2013-10-14 22:14:54

请问你了解这方面的信息吗
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3楼2013-10-16 12:53:25
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
安蓉: 金币+2 2013-10-18 09:02:06
亨德森方程可计算
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4楼2013-10-16 18:43:00
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
★ ★ ★
安蓉: 金币+3 2013-10-18 09:01:59
pKa可以计算 也可以预测，化学研究人员很熟悉的，pkA
固定是针对一个特定的条件下是固定的，祝你好运
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5楼2013-10-16 18:43:46
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安蓉

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hl16010921 at 2013-10-17 08:29:20
pKa一般是某一基团的解离常数，一般为酸性基团，例如磷酸有pKa1，pKa2和pKa3.对特定分子的pKa是固定的（水溶液，稀溶液）所以蛋白的pKa没啥意义吧，一般只有等电点，有些可以查到，有些可以用等点聚焦测出。至于某p ...

啊啊啊？“至于某pH值下的缓冲体系中，所有同种蛋白的带电情况是相同的，不存在中性分子比例问题。”那也就是我的这种情况根本就不存在，没有中性分子之说。。。您这句话在哪里有出处吗？我想研读下，大侠可否推荐下哈
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7楼2013-10-18 09:00:30
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安蓉

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhouxj at 2013-10-16 18:43:46
pKa可以计算 也可以预测，化学研究人员很熟悉的，pkA
固定是针对一个特定的条件下是固定的，祝你好运

我也是化工的，但是这个是蛋白，我问了好些人，他们都不知道怎么弄，我只看到氨基酸的PKa，但是蛋白质的有等电点，我就懵了，请问您有何建议哈？
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8楼2013-10-18 09:01:49
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安蓉

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhouxj at 2013-10-16 18:43:00
亨德森方程可计算

这个公式好像计算不了呢，大侠可以说具体点吗
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9楼2013-10-18 09:02:27
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hl16010921

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
安蓉: 金币+4 2013-10-18 18:51:22
引用回帖:
7楼: Originally posted by 安蓉 at 2013-10-18 09:00:30
啊啊啊？“至于某pH值下的缓冲体系中，所有同种蛋白的带电情况是相同的，不存在中性分子比例问题。”那也就是我的这种情况根本就不存在，没有中性分子之说。。。您这句话在哪里有出处吗？我想研读下，大侠可否推荐 ...

在等电点时，所有该蛋白都是中性的。低于等电点，带正电的平衡，这时某一蛋白的带电情况就是一定的了，所有的蛋白都带正电且带的电荷是一致的（动态一致的）。此时不存在中性分子。同理高pH值也是一样的。不存在中性分子呀。否则，试想电泳时，同种蛋白应该分成不同的条带，而不是单一条带
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10楼2013-10-18 09:14:40
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
安蓉: 金币+4 2013-10-18 18:51:41
引用回帖:
8楼: Originally posted by 安蓉 at 2013-10-18 09:01:49
我也是化工的，但是这个是蛋白，我问了好些人，他们都不知道怎么弄，我只看到氨基酸的PKa，但是蛋白质的有等电点，我就懵了，请问您有何建议哈？...

等下我吧那个网址给你发过来，非常不错的预测网址
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11楼2013-10-18 10:29:08
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安蓉

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by hl16010921 at 2013-10-18 09:14:40
在等电点时，所有该蛋白都是中性的。低于等电点，带正电的平衡，这时某一蛋白的带电情况就是一定的了，所有的蛋白都带正电且带的电荷是一致的（动态一致的）。此时不存在中性分子。同理高pH值也是一样的。不存在中 ...

哦，是这个意思啊，那我的想法是有问题的了，谢谢了啊
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12楼2013-10-18 18:51:17
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安蓉

木虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by zhouxj at 2013-10-18 10:29:08
等下我吧那个网址给你发过来，非常不错的预测网址...

啥时候发过来啊，牛人
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13楼2013-10-18 18:51:37
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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13楼: Originally posted by 安蓉 at 2013-10-18 18:51:37
啥时候发过来啊，牛人...

http://muchong.com/html/201009/2331327.html 看看先用这个软件，网址一下怎么找不见呀
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14楼2013-10-18 22:11:57
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安蓉

木虫 (正式写手)
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15楼: Originally posted by zhouxj at 2013-10-18 22:18:13
ACD_labs软件可以...

恩好的，谢谢咯
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16楼2013-10-19 09:44:43
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yingying15882楼
2013-10-14 22:14  
亦岳986317楼
2013-10-19 10:16  
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