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作者
最后发表
第一性原理
从VASP的OUTCAR提取xyz以及结构优化的轨迹
另外在linux下,还可能需要使用命令
dos2unix
来去掉文件里每行多余隐藏的字符:dos2unixgetvaspxyz.sh。在含有OUTCAR文件的目录下运行getvaspxyz.sh,就可以取出原子的位置,以及原子所受的...
valenhou001
2019-10-29 07:52
计算模拟
如何从.gjf文件转换成.lsf文件呢?
我想问一下如何从.gjf文件转化成.lsf文件呢?我不会转化,求大神帮忙。最好用
dos2unix
来转换。
houhou0123
2018-05-23 01:17
第一性原理
【小福利】VASP频率计算可视化方法
注意:生成的OUTCAR.mkl文件不要忘记从
unix
转为
dos
格式:
unix2
dosOUTCAR.mkl;在windows下面运行的可能不需要转附:molekel4.3.win32软件使用方法(1)运行molekel4.3.win32.exe文件(
2
)在出来...
zhangguangping
2016-04-12 03:23
第一性原理
windows下运行QE求指导
本人主要做材料合成和表征的,不是计算机模拟党,想涉猎一下第一原理做点小计算,例如材料的能带结构、
DOS
和PDOS,最多也就延伸到弹性模量...让我这样深受windows荼毒的人看见了希望,
unix
什么...
不明觉厉
2015-05-29 08:54
版块工场
维基百科中的【AutoCAD】词条
完善阶段[编辑]AutoCADR13——1994年11月在
Unix
、
DOS
和Windows3.11上的最后版本AutoCADR14——1997年
2
月AutoCAD2000(R15.0)——1999年3月AutoCAD2000i(R15.1)——2000年7月进一步完善阶段...
mysoybean
2015-02-13 12:15
量子化学
G09安装问题求助
各位好,我在安装linux下的G09时遇到了这样问题:
dos2unix
没有将GJF转化成DOS文件,不知怎么回事啊?求助大家了。(自己装的系统,自己装软件,新手)2014-09-17_121244.jpg
liujodan
2014-09-17 04:28
分子模拟
教程-使用MolCal计算蛋白质-纳米管的半径
见'...当一切准备就绪,启动
DOS
终端或者linux的终端,切换到要计算的目录,直接输入#java-jarMolCal.jarparameter.dat其中MolCal.jar要输入对应的版本,例如是1.0b1,放在了D:/soft,应该是...
javacfish
2014-08-15 10:42
程序语言
在一本Fortran书里发现几个低级错误
2
,(MS的VisualFortran)克服了过去Fortran77只能在
DOS
下编程(的缺点)(作者听说过
UNIX
么?早前听人说这本书是从VisualFortran的帮助文件翻译的,水平不高。今天发现确实如此,于是决定...
beefly
2014-07-29 09:56
量子化学
麻烦帮忙看看G03安装后运行结果
粘贴到Ubuntu下,用
Unix2dos
转化了一下。然后用g03/home/lue/GaussTemp/c60.gjf运行。c60.log文件如下:EnteringGaussianSystem,Link0=g03Input=home/lue/GaussTemp/c60.gjfOutput=home/lue...
lue7
2014-03-19 06:28
计算模拟
高斯计算速率 出现问题 帮忙看下
[rootlocalhostvkrate]#
dos2
unixCHOMV.datdos
2unix
:convertingfileCHOMV.dattoUNIXformat.[rootlocalhostvkrate]#./RateCHOMV.datCHOMV....bad_alloc'what():std:bad_alloc已放弃(coredumped)...
xingfujia1
2013-12-11 03:58
量子化学
gassian 不能运行 permission denied
将输入及运行文件上传至服务器运行,总是出错e文件中提示如下:
dos2unix
:convertingfiletri3.gjftoUNIXformat./var/spool/PBS/mom_priv/jobs/52810.node1.SC:line9:/home/g03/g03:...
qingeraaa
2013-04-24 05:17
仿真模拟
linux环境下通过jou文件调用fluent的case,case带有udf,jou文件...
在linux环境下运行fluent,要通过编写jou文件来调用case文件,case文件中带有udf的话,jou文件应该做什么改变呢?另外,udf的那个文件是不是也应该用
dos2unix
转换一下
200711118
2013-03-18 02:57
仿真模拟
在linux中算fluent时采用解释性UDF时出错
在网上查询时,有人说时是格式不对,需要用
dos2unix
进行格式转换然而在对thetmal.c这个UDF文件进行转换时,发现转换不成功:[rootnode1~]#dos2unixthetmalconduct.cdos2unix:...
zoupeng2046
2013-02-27 03:50
程序语言
dos2unix
求助如何在linux系统下安装
dos2unix
!要是能附上
dos2unix
附件的话,不胜感激!
568286346
2012-11-23 01:43
程序语言
linux系统下 ifort的安装
在centos6.3linux系统中如何安装ifort(本人根据centos5.5linux系统中安装ifort的方法安装,安装完成之后whichifort显示正常,但是却显示
dos2unix
没有,因此无法安装tinker),恳请得到各位...
568286346
2012-11-22 09:55
量子化学
Failed to open output temp file
在服务器上交作业
dos2unix
文件名后显示“Failedtoopenoutputtempfile:Read-onlyfilesystem”,并且向服务器传任务时显示encountered1errorsduringthetransfer,想问问各位大师这是哪里出了...
ivylxjlove
2012-10-18 09:46
分子模拟
高斯生成.log文件出错,生成nohup.out文件
将windows中生成的.gjf文件,在linux中用高斯产生.log文件时步骤如下[g09server001DOCKING]$
dos2
unixegcg.gjfdos
2unix
:convertingfileegcg.gjftoUNIXformat.[g09server001DOCKING]$chmod+...
倩430
2012-10-10 01:02
休闲灌水
360=250+110【转载】,题目是老汉改的
侯义斌是个大牛啊,80年代,用
2
年9个月就从荷兰爱因霍芬大学...这时,我们本科毕业的一帮同学,有分配到北大方正的,那时候在给银行做管理系统的,用pc版的
unix
,叫什么xnix,当时这个帮哥们动...
yalefield
2012-10-01 08:15
量子化学
谁能解释下俺们家这root用户和gauss用户的权限问题
高斯不给算了~无论是
dos2unix
还是别的打开文件夹的命令,都提示我,米有权限。我就奇了怪了,纳了闷了,到底咋了咩?在师姐的机子上这些问题就没有了,难道是我电脑的事。下面列出其中一个...
qyyos
2012-06-01 08:58
电脑使用
CMD命令集
router.exeroutersoftwarethatrunseitheronadedicateddosoronanos/
2
system.route软件在
dos
或者是os/
2
系统rsh.exerunscommandsonremotehostsrunningthershservice在运行rsh服务的远程...
黑色风信子
2012-05-24 05:25
量子化学
XXXX command not found
本人普通用户修改的环境变量为/home/.bashrc...这一步没弄好,后面测试test就出现这个bash:
dos2unix
:commandnotfoundbash:g09:commandnotfound求详解,望高手不吝赐教,菜鸟先行谢过了。
leospindrift
2012-04-09 06:48
量子化学
模糊的重定向 problems
swuswu-OptiPlex-990:~cd/home/swu/桌面/wmsswuswu-OptiPlex-990:~/桌面/wms$
dos2unix
*.*
dos2unix
:convertingfileag09.shtoUnixformat.
dos2unix
:convertingfileoptts-benchan.gjf~...
wms07
2012-01-10 01:18
第一性原理
【活动and资源】vasp的警告、报错信息及解决办法-欢迎大家补充
传到
unix
系统...或者
dos2
unixfilename4.VASP计算出现SegmentationFault而终止运算在makefile中FFLAGS后面添加-heap-arrays,例如:FFLAGS=-FR-lowercase-assumebyterecl-heap-arrays...
uuv2010
2011-06-25 02:50
第一性原理
【活动or资源】vasp晶体结构优化
最好
dos2unix
一下再改变一下权限chmod+xrvasp,最后运行./rvasp即可第三步:运行脚本以后在SUNMMRY可以找到体积比例与对应的能量,我们未必一定把体积算出来,用体积比例可以得到拟合曲线,...
贺仪
2011-05-26 06:23
量子化学
【求助】Gaussian(Linux)计算提交问题
另,将windows下创建的输入文件Cate.gif转化进入Cate.gif所在目录终端显示:dos2unixcate.gifdos2unix:convertingfileCate.giftoUNIXformat…
dos2unix
:problemsconvertingfileCate.gif[1]+...
yangyanli_en
2011-03-21 01:19
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