24小时热门版块排行榜    

查看: 1390  |  回复: 8
【悬赏金币】回答本帖问题,作者yuankanxue将赠送您 5 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yuankanxue

金虫 (著名写手)

分子玩家

[求助] ORCA测试无法打开输入文件!已有1人参与

简单介绍下,我是新手,想使用orca做一些计算。在测试过程遇到了问题,具体过程如下:
第一步,我根据论坛帖子”http://muchong.com/t-15305542-1“的内容,从版主提供的网盘链接下载了windows压缩版orca,最后将三个压缩文件解压到一个文件夹。
第二步,同时下载安装了最新版的microsoft  mpi的msi文件 v10.1.12498.52, 并进行了安装。
第三步,按说明将文件夹路径添加为系统环境路径。
第四步,参考orca在线说明书“https://www.orcasoftware.de/tuto ... s/input_output.html”测试第一个例子water。但是应有的结果没有出来,具体如下:
……
this orca versions uses:
   cblas   interface :  fast vector & matrix operations
   lapacke interface :  fast linear algebra routines
   shared memory     :  shared parallel matrices

[file orca_main/run.cpp, line 11467]: cannot open input file: water.inp
[file orca_main/run.cpp, line 11467]: cannot open input file: water.inp

说明一下,文件"water.inp"是我使用官方建议的notepad++复制官方数据保存的文件。
在线文档解释这种错误提示常见有两种情况,一个是输入文件类型,第二是系统环境变量未设置好。我反复检查这两点没有发现问题。所以来论坛向大家求助了。
回复此楼
有志者事竟成,梦想给我方向,方法是效率,努力是捷径,失败是老师。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paramecium86

版主 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yuankanxue at 2023-09-20 02:18:46
还有一个问题,请问版主,ORCA能不能把分子结构式画出来?每个原子旁边加上编号,就用原子坐标对应的编号。...

ORCA的可视化程序可以试试Chemcraft。 如果你用xyz文件 还可以就常规的用 vmd来作图
5楼2023-09-22 12:43:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yuankanxue: 金币+2, 有帮助 2023-09-20 08:56:16
yuankanxue: 金币+8, ★★★很有帮助 2023-09-20 09:03:32
yuankanxue: 金币+5, ★★★很有帮助 2023-09-23 13:42:00
看起来运行的时候 orca没有找到对应的water.inp文件。
2楼2023-09-19 22:13:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuankanxue

金虫 (著名写手)

分子玩家

引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2023-09-19 22:13:23
看起来运行的时候 orca没有找到对应的water.inp文件。

谢谢版主提示!问题已解决。我仔细想了想是默认的工作路径不在我存放“water.inp"的路径下。我原以为添加了系统环境变量路径后,该路径下的“water.inp"文件也能被查到。
有志者事竟成,梦想给我方向,方法是效率,努力是捷径,失败是老师。
3楼2023-09-20 09:05:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuankanxue

金虫 (著名写手)

分子玩家

引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2023-09-19 22:13:23
看起来运行的时候 orca没有找到对应的water.inp文件。

还有一个问题,请问版主,ORCA能不能把分子结构式画出来?每个原子旁边加上编号,就用原子坐标对应的编号。
有志者事竟成,梦想给我方向,方法是效率,努力是捷径,失败是老师。
4楼2023-09-20 15:18:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 求Sci期刊推荐 10+3 甄小鱼 2024-05-30 6/300 2024-05-31 15:49 by topedit
[教师之家] 在大地上我们只过一生---看完我的阿勒泰上头了好几天,完结那天晚上几乎失眠 +10 瞬息宇宙 2024-05-27 11/550 2024-05-31 15:38 by 烟 火
[教师之家] 双非本科毕业论文,气人 +3 河西夜郎 2024-05-27 4/200 2024-05-31 13:10 by iwdw2012
[基金申请] 离职后国自然项目不能变更单位,在新单位还能申请新的国自然项目吗 5+3 宜兰 2024-05-31 6/300 2024-05-31 12:05 by felicity6056
[教师之家] 研究生在毕业答辩时挂了,遗憾 +9 spacr2022 2024-05-27 12/600 2024-05-31 10:17 by zzq770204
[硕博家园] 要不要读博 +16 王乔木 2024-05-24 18/900 2024-05-31 10:09 by caocao4735
[基金申请] 入职高校3年发表10+SCI,尽人事听天命 +29 kaoyan250 2024-05-27 40/2000 2024-05-31 08:44 by Xiaolin81
[硕博家园] 哈工大硕博招生!博士每月入学! +3 nailooo 2024-05-30 4/200 2024-05-30 21:59 by MarioSaint
[材料综合] 真空封石英管 北京 +4 dessha 2024-05-29 5/250 2024-05-30 16:40 by mpdfwxgui
[论文投稿] 审稿专家比较坚定的让补充实验,但实在没法补充实验,修回还有希望吗? (EPI+1) 3+3 qweasd12345 2024-05-29 6/300 2024-05-30 08:11 by qweasd12345
[硕博家园] 论大家对6070后普通教授导师的看法 +5 SNaiL1995 2024-05-28 9/450 2024-05-29 21:54 by SNaiL1995
[论文投稿] 有没有老师需要发表论文 +4 金老师论文助理- 2024-05-29 4/200 2024-05-29 16:51 by liuyupu132
[考博] 申博求助?本硕双非一篇三区和四区去985工科非天坑专业有没有希望? +3 LYS1200 2024-05-29 5/250 2024-05-29 14:45 by 未来富婆蛙
[基金申请] 信息学部函评结束了吗? +6 ducan21 2024-05-28 7/350 2024-05-29 12:10 by WORLD0256
[论文投稿] EI学报,一审返修后,为啥不再送审,直接终审中? +4 qweasd12345 2024-05-27 6/300 2024-05-29 00:02 by dut_ameng
[硕博家园] 文科博在木虫上存在感好低呀 +8 hahamyid 2024-05-25 11/550 2024-05-28 15:28 by cqu_zzh
[论文投稿] EI期刊审稿人邮箱问题 5+3 shier妈妈 2024-05-27 4/200 2024-05-28 14:53 by topedit
[材料综合] 求助,刚入门MOF合成,实验总是失败 20+3 张月半 2024-05-25 8/400 2024-05-28 09:20 by 我想更懂你29
[硕博家园] 我是很理想化一人 +6 hahamyid 2024-05-26 6/300 2024-05-27 18:13 by 大飞鱼鱼鱼
[硕博家园] 2024博士招生 +3 big 混子 2024-05-26 3/150 2024-05-26 20:47 by 宁多缺毋滥
信息提示
请填处理意见