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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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卧胜于坐

新虫 (小有名气)

[求助] HMMER软件hmmsearch报错无法打开序列Failed to open sequence file怎么办已有2人参与

用hmmer对拟南芥蛋白某家族构建了隐马尔可夫模型hmm文件,然后下载了目标物种的蛋白序列文件,运行
> .\hmmsearch 基因名.hmm 文件名.fa>基因名.out

结果报告:
Failed to open sequence file 文件名.fa>基因名.out for reading

无法生成.out文件
fa后缀换成fasta不行,下载了embl格式的txt也不行,哭了
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灵素古今

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

可以联系我帮你看看,QQ741203646
2楼2020-12-30 13:35:55
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

肯定不是后缀名的问题,你把这个fa文件拖进记事本里看看什么样子?最好截个图发上来。

如果文件太大,记事本打开会有困难。那就下载一个ultraEdit或者gVIM打开
3楼2021-01-05 10:17:30
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