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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 并行计算的问题 “Fatal error in MPI_Abort”
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Mady_Horse

新虫 (小有名气)

[求助] 并行计算的问题 “Fatal error in MPI_Abort”已有3人参与

在使用Dmol3优化结构时任务出错，返回的文件里显示如下内容，不知道是怎么回事，求解决办法

Message: SCF not converging. Choose larger smearing value in DMol3 SCF panel
or modify/delete "Occupation  Thermal" in the input file.
You may also need to change spin or use symmetry.
Resubmit DMol3.
Errors from parallel task 2:
Peak memory usage: 641272 kB on current thread
... Calling mpi_abort ...
Checked out license feature: MS_dmol_site <v2014.10> [for msi] (2 copies)

Checked out license feature: MS_dsolid_site <v2014.10> [for msi] (2 copies)

Fatal error in MPI_Abort: Invalid communicator, error stack:
MPI_Abort(141): MPI_Abort(comm=0x0, errorcode=200) failed
MPI_Abort(79).: Invalid communicator
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1楼2018-03-26 16:44:17
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lqfwww

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
破解没有成功，lic错误导致mpi无法调用
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

Mady_Horse
2楼2018-03-28 10:24:19
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Mady_Horse

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by lqfwww at 2018-03-28 10:24:19
破解没有成功，lic错误导致mpi无法调用

感谢回复，重新破解注册后进行计算，还是出现一样的问题，所以我觉得可能是另外的原因。又或者是我的破解文件出了问题，但注册时没有报错，并且网上大多用此类文件，可能性不大。现在问题还未解决...
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3楼2018-03-29 16:34:30
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嘿东子

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by Mady_Horse at 2018-03-29 16:34:30
感谢回复，重新破解注册后进行计算，还是出现一样的问题，所以我觉得可能是另外的原因。又或者是我的破解文件出了问题，但注册时没有报错，并且网上大多用此类文件，可能性不大。现在问题还未解决......

您好，请问问题解决了吗
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4楼2018-05-08 09:04:35
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nfer

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

找个别的机子试试
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5楼2018-05-21 10:39:59
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专心学术

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by Mady_Horse at 2018-03-29 16:34:30
感谢回复，重新破解注册后进行计算，还是出现一样的问题，所以我觉得可能是另外的原因。又或者是我的破解文件出了问题，但注册时没有报错，并且网上大多用此类文件，可能性不大。现在问题还未解决......

请问一下，最后问题解决了吗
同时遇到了这样的问题，想要前辈的指点
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6楼2018-05-30 10:13:40
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Mady_Horse

新虫 (小有名气)
向别人请教了一下，应该是计算量太大，并行计算时数据交换出现了问题。后面换了个小点的体系就没问题了。或者可以试一下换基组，调大DIIS或smearing之类的
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7楼2018-11-27 11:19:14
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泡花alkali

新虫 (小有名气)
我也Errors from parallel task 2:
Signal Caught:            2
Peak memory usage: 491652 kB on current thread
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8楼2019-07-23 16:48:23
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