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功能材料 lammps交流
有限尺寸线性分割(2D)和三角形(3D)粒子,点偶极粒子,刚性集合粒子,这些模型的的杂化类型二面角势能,纠正势能,聚合物势能,水势能,隐式溶剂势普适化力场,氢键,纳米复合材料,环氧树脂...
赵婷婷zm 2019-04-25 11:59
分子模拟 gromacs交流
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赵婷婷zm 2019-04-25 11:16
分子模拟 lammps交流
有限尺寸线性分割(2D)和三角形(3D)粒子,点偶极粒子,刚性集合粒子,这些模型的的杂化类型二面角势能,纠正势能,聚合物势能,水势能,隐式溶剂势普适化力场,氢键,纳米复合材料,环氧树脂...
赵婷婷zm 2019-04-25 11:47
生物材料 lammps
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赵婷婷zm 2019-04-25 11:03
电化学 lammps与gromacs交流
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赵婷婷zm 2019-04-25 11:38
高分子 lammps与gromacs交流
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赵婷婷zm 2019-04-25 11:52
物理 lammps与gromacs交流
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赵婷婷zm 2019-04-25 11:46
精细化工 lammps交流
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赵婷婷zm 2019-04-25 11:57
无机非金属 lammps交流
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赵婷婷zm 2019-04-25 11:17
石油化工 lammps与gromacs交流
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赵婷婷zm 2019-04-25 11:35
新药研发 lammps与gromacs交流
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赵婷婷zm 2019-04-25 11:47
无机/物化 lammps与gromacs交流
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赵婷婷zm 2019-04-25 11:05
药学 gromacs与lammps交流
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赵婷婷zm 2019-04-25 11:45
生物科学 gromacs与lammps交流
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赵婷婷zm 2019-04-25 11:21
无机非金属 lammps与gromacs
有限尺寸线性分割(2D)和三角形(3D)粒子,点偶极粒子,刚性集合粒子,这些模型的的杂化类型二面角势能,纠正势能,聚合物势能,水势能,隐式溶剂势普适化力场,氢键,纳米复合材料,环氧树脂...
赵婷婷zm 2019-04-25 02:54
生物科学 lammps和geomacs 交流
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赵婷婷zm 2019-04-25 02:10
无机/物化 lammps与gromacs 咨询
有限尺寸线性分割(2D)和三角形(3D)粒子,点偶极粒子,刚性集合粒子,这些模型的的杂化类型二面角势能,纠正势能,聚合物势能,水势能,隐式溶剂势普适化力场,氢键,纳米复合材料,环氧树脂...
赵婷婷zm 2019-04-25 02:15
分子模拟 转data文件
1我在MS里面建好模型后,转出pdb文件,再用VMD转data文件,得到的data文件里面没有键角和二面角信息我模拟的是材料的力学性能,模型的键角信息在data文件里应该要有吧。2大家在做分子动力学...
S-Loser 2019-04-02 12:35
计算模拟 VMD读取psf错误
请问虫友们,我psf里的键长、键角及二面角等都准备齐全了,为什么在vmd里全都读取不出来呢?求解决方案?急急急!
一时花开11 2019-03-28 06:15
分子模拟 Pattern不见了
在用AC建模的时候,用findpattern工具标记了键长,键角和二面角,并把它各自标记为set,但是用搭建交联结构的脚本后,却发现set消失了,请问各位大佬,这是怎么回事?如何解决呢?...
erdoslm 2019-03-23 08:10
分子模拟 martini粗粒化参数
我的粗粒化的itp文件的二面角的参数如下图,这种二面角应该是用函数类型9,但往itp文件中写的时候该怎么写?123491801.96100.18200.33300.124这么写对吗
jfxjfx 2019-03-02 12:08
分子模拟 新手小白求助!
新手小白求助,要用lammps模拟一种烷烃液滴,不知道data文件里的dihedrals(二面角扭转势)的编写格式。另外要怎么查到某种烷烃中的各个二面角的度数,data文件里的角度是弧度制还是角度制?...
lukai_1996 2019-01-15 07:30
计算模拟 全原子分子动力学力场的参数化
键长、键能、键角是不是可以通过量子计算优化出的结构直接给出键长、键能、键角,那键的扭转能和二面角怎么给出来呢?2.不同原子对L-J势中的参数(势阱和接触距离)是通过量子计算出的相互...
tianxia-feng 2018-12-28 08:25
分子模拟 运行时出现了这样的警告了,有没有大神提点一下该怎么解决?
二面角为什么怎么修改都会出现这样的警告V9RM27GX`2NV3%SA~7VH_}T.png_GOK678A1}{6%CUS2CJ8UK9.png
花先森 2018-12-24 03:24
药学 “Magic Methyl-Thermodynamics vs Kinetics”转载自叮叮药化
对模板片段3-piperidinesubstituentc2-c3-c-h二面角180°扫描发现(fig.1):与h-analogue相比,虽然methyl-analogue从最低能量构象二面角c2-c3-c-h调整到结合构象二面角c2-c3-c-h有0.4kcal...
卡西莫多 2018-12-24 01:14