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第一性原理
第一性原理
通过满足不断变化的计算、延迟和带宽需求,迅速应对数据增长
问题
;通过统一的系统...5)开发环境管理功能:支持
安装
自定义操作系统,平台内置TensorFlow、Pytorch等常见的机器学习框架镜像;...
A宝禄计算
2023-05-23 05:42
分子生物
计算机辅助药物设计(CADD)如何入手,速看(包含
gromacs
).
蛋白相互作用原理1.2分子对接研究生物分子相互作用1.3蛋白...分子动力学简介(
gromacs
软件)1.1分子动力学基本原理1.2linux系统介绍1.3分子动力学软件介绍(
gromacs
)2.
gromacs
进行分子动力学...
科研小生k
2023-04-27 02:19
硕博家园
计算机辅助药物设计(CADD)如何入手,速看.
蛋白相互作用原理1.2分子对接研究生物分子相互作用1.3蛋白...分子动力学简介(
gromacs
软件)1.1分子动力学基本原理1.2linux系统介绍1.3分子动力学软件介绍(
gromacs
)2.
gromacs
进行分子动力学...
科研小生k
2023-04-21 02:28
医学
生物医药领域发文难?(CADD、ROSETTA、多组学)一区SCI垫脚石已...
蛋白相互作用原理1.2分子对接研究生物分子相互作用1.3蛋白...分子动力学简介(
gromacs
软件)1.1分子动力学基本原理1.2linux系统介绍1.3分子动力学软件介绍(
gromacs
)2.
gromacs
进行分子动力学...
科研小生k
2023-04-19 02:44
分子模拟
分子动力学模拟及其LAMMPS实现
分子动力学基础1.1原理.1.2势能1.3温度、压强2.linux系统常见命令和操作3.lammps介绍和并行版
安装
(linux版)4.lammps模拟基本流程...我将分子动力学研究科学
问题
分为三个部分:软件使用,分子...
luyaobao
2022-05-22 06:58
新药研发
计算机辅助新药设计药物发现-CADD-AIDD-虚拟筛选-毒性预测-分子...
基于EGFR野生型与突变型靶点受体结构变化理解药物设计原理...(1)基于分子对接技术筛选EGFR小分子抑制剂(2)基于分子对接技术筛选HDAC小分子抑制剂(第三天)分子动力学模拟分子动力学
gromacs
...
emmmlll
2022-01-05 10:20
分子模拟
CADD-AIDD-蛋白-抑制剂-药物设计-药物发现-分子对接-分子动力学
基于EGFR野生型与突变型靶点受体结构变化理解药物设计原理...(1)基于分子对接技术筛选EGFR小分子抑制剂(2)基于分子对接技术筛选HDAC小分子抑制剂(第三天)分子动力学模拟分子动力学
gromacs
...
emmmlll
2022-01-03 09:19
分子模拟
lammps模型案例干货基础入门内容线上不停学
传统实验需要大量的人力物力而且耗时,而计算机模拟的方法省时省力,可以用来求解解析理论无法求解的
问题
,模拟实验做起来困难或不...其他相关软件的功能介绍,如
GROMACS
、VASP、NAMD、MS等2....
dhyfgj111
2020-04-15 05:52
分子模拟
namd
安装问题
求助
我之前成功
安装
过
gromacs
也加入了cuda选项之后编译成功,所以感觉我的cuda10-2应该没有
问题
。求教大家是什么原因。麻烦大家了谢谢啦。微信图片_20200228181627.jpg微信图片_20200228181638....
19800617
2020-02-28 10:55
分子模拟
tCONCOORD运行失败,显示GMXLIB路径有
问题
。
新手想要用tCONCOORD采集蛋白构象,官网显示运行这个需要
安装GROMACS
,还有配置GMAXLIB环境变量,这些我都完成了,但是运行时还有
问题
。1.tCONCOORD运行显示如何错误:BackOff!...
Echoyunli
2019-10-17 06:26
计算模拟
如何学习
GROMACS
?
有两个
问题
请同行帮忙解答:1.除了一些网上的论坛外,是否有一些好的教材可供学习,我是指学习
GROMACS
,不是指分子动力学,说明:我...普通台式机上
安装
Linux或Unix后,是否可以
安装GROMACS
?...
xueyajuan
2019-02-13 07:31
分子模拟
Gromacs
命令无法执行
pdb2gmx-bash:pdb2gmx:commandnotfound我看了本版也有类似
问题
,说是路径没有配置,可我配置路径了啊,
安装
成功cmake.-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=opt/
gromacs
-5.0.2-DGMX_FFT_LIBRARY=fftw3-...
xzhfood
2018-12-07 03:03
分子模拟
gromacs安装问题
本人是linux新手,
安装gromacs
是总是出现
问题
,如图,求教各位大神IMG20180619153747.jpg
jfxjfx
2018-06-19 07:15
分子模拟
gromacs安装问题
本人模拟新手,正在
安装gromacs
,各种懵逼,遇到一个一直过不去的
问题
,还请各位走过路过的大神指点一二。目前已完成:用virtualbox的虚拟机,
安装
了centos7的linux系统,完成openmpi-3.1.0...
陈晓苏叶
2018-06-18 10:05
分子模拟
liniux系统中同时
安装gromacs
与material studio的gateway
问题
我先
安装
了
gromacs
,可以正常运行,后
安装
materialstudio过程中也没报错,但是MS的gateway无法运行,用命令运行MS的gateway时,总是提示已经有一个正在运行的gateway,不知道
问题
出在哪里,...
小四黑906
2018-06-11 11:48
分子模拟
怎么计算MM-PBSA
我想用
Gromacs
4.6.5计算蛋白与配体的结合自由能,请问各位大神需要
安装
哪些软件呢?在g_mmpbsa网站按步骤做的,可是在编译
Gromacs
时就出现了
问题
。是不是需要下载编译器啊?
huyanqiu
2018-06-07 02:04
分子模拟
cmake
安装
出错
大家好,我想用cygwin安装
gromacs
,
安装
过程如下:将安装包拷贝到了home/xing里面;tarxvzfcmake-...cdcmake-3.6.2./bootstrap运行一段时间之后出现如下
问题
:CMakeError:Couldnotfind...
cuoce
2017-10-22 01:48
分子模拟
Gromacs安装问题
请大神帮忙,之前
安装
的
gromacs
是5.1.4版本的,在听一个入门引导课程的时候,讲课的老师说这个版本opls力场有
问题
,于是我就想
安装
2017年3月的那个版本,可是用cmake
安装
过程中就会出现the...
llllemonade
2017-08-18 12:34
计算模拟
lammps运行一定步数后停止(感觉是MPI的
问题
)Signal:...
lammps
安装
好之后试着跑过例子,并行串行都没
问题
。...在lammpsuser里面看到有人回复说这不是lammps的错,是cluster的
问题
,不过我们的机子上跑其他软件并行没
问题
,
gromacs
,高斯都可以。...
鱼叉君
2017-06-26 02:21
分子模拟
[培训通知]关于开展《基于MAPS的多尺度材料及化工过程模拟专题...
本次培训旨在向希望利用MAPS来解决相关工程
问题
的研究人员、工程技术人员提供一个基本的MAPS介绍和入门培训,使广大学员通过培训...掌握LAMMPS、
GROMACS
、MS等材料领域经典软件的使用,在表面...
NSCC-GZ
2017-05-15 08:20
分子模拟
Gromacs安装问题
,ubuntu系统内核安装后怎么编译?
小白,初次接触
Gromacs
,
安装
的Ubuntu内核的软件,也已经安装了fftw,但是
Gromacs安装
后找不到安装在哪儿了?看网上说要设置环境变量,不知道/usr/bin目录在哪儿?还请大神们指点
Ivy286
2016-12-22 09:50
分子模拟
gromacs安装问题
,求大神指教
1)我想在机群的个人账号中
安装
并行版
gromacs
-4.5.5,经过解压缩指令:tar–zxvffftw-3.3.4.tar.gztar–zxvflam-7.1.3.tar.gztar–zxvf
gromacs
-4.5.5.tar.gz2)之后输入指令如图:...
howardloveme
2016-11-23 03:29
分子模拟
求
gromacs
5.0 的 pbs 脚本
最近在学习
gromacs
的使用,目前在RedHatEnterpriseLinux6的节点上
安装
了
gromacs
5.1.4。登陆节点上使用正常,但是并行计算时,提交...脚本有
问题
,请问有人可以提供该类脚本例子吗?...
zhyh_
2016-09-18 11:44
分子模拟
求
gromacs
5.0 的 pbs 脚本
最近在学习
gromacs
的使用,目前在RedHatEnterpriseLinux6的节点上
安装
了
gromacs
5.1.4。登陆节点上使用正常,但是并行计算...use=0,判断是pbs脚本有
问题
,请问有人可以提供该类脚本例子吗?...
zhyh_
2016-09-18 11:38
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