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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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笑笑打dota

金虫 (小有名气)

[求助] 请问怎么将两个已知蛋白进行叠合,分析其中一个蛋白的活性中心部位? 已有2人参与

各位大神,我从PDB数据库里搜到A、B两个蛋白的PDB文件,A的活性中心已报道,请问怎么将他们进行叠合用A的活性中心分析B的活性中心部位?A、B是来源不同的同一种酶。
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笑笑打dota

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by francstone at 2016-03-02 16:52:12
啥意思?还有偿服务啊
...

额,不知道怎么送悬赏的金币。。。
9楼2016-03-02 23:23:03
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好孩子坏孩子

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用Pymol打开两个蛋白后Align
2楼2016-02-22 13:23:51
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francstone

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
笑笑打dota: 金币+5, 有帮助 2016-03-02 15:39:38
用ccp4里面的superpose指定需要叠合的部分,然后用coot或者pymol打开生成的PDB文件,就可以看到你关心位置的叠合情况
3楼2016-02-23 13:25:20
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笑笑打dota

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 好孩子坏孩子 at 2016-02-22 13:23:51
用Pymol打开两个蛋白后Align

谢谢指教
4楼2016-03-02 15:36:50
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