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weiweitt

铁虫 (初入文坛)

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[求助] 用基因组DNA当模版为何扩增出CDS 已有3人参与

1.目的条带包含2个外显子加1个内含子，全长约700bp.内含子稍大于100bp。
2.用CTAB法提取植物叶片的基因组DNA做模版
3.扩增出两条带一条700bp左右正是目的条带。另一条大小500bp多，切胶回收连载体测序后发现正好是两个外显子相加没用内含子的部分，
也就是说，我用基因组DNA扩增出了CDS，请问会有什么样的可能来解释这一现象？
PS：怀疑我的DNA可能有RNA的污染，我于是将DNA用RNA酶消化了一个小时，结果仍是上述结果。

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1楼 2016-02-19 00:08:34

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weiweitt

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引用回帖:

8楼: Originally posted by weiweitt at 2016-02-23 15:28:31
我的引物就是跨着内含子，扩出来的东西就应该是外+内+外这样一段东西，结果我扩增出了两条带，把这两条带都回收测序了，一条就是预期的外+内+外，另一条是外+外，中间100多bp的内含子没有了。所以我不明白多出来的 ...

哦不好意思，没太看懂您的建议，能说的仔细些吗