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关于分子优化的问题,向各位请教已有2人参与
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dxyan
木虫 (正式写手)
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初始结构不同,即便算出来4个Yes,没虚频,能量也不一样。我计算就存在这样的问题,也很纠结怎么找到一个合适的结构。现在只是根据一些化学基本知识改变初始结构,最后选择一个能量最低的做优化结构。不过感觉很随机的感觉。尤其碰到复杂大分子。 发自小木虫IOS客户端 |
14楼2016-02-19 10:01:43
wearethefire
新虫 (初入文坛)
2楼2016-02-17 19:57:53
3楼2016-02-17 19:59:08
不取俗名
木虫 (正式写手)
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1.我推测,你所谓的芳香键指的是CN间,但是值得注意的是,判断是否是芳香键远没有想象中那么简单,这边出现键的模式,仅仅是一个软件的阀值自动判断的,也就是说并没有特别强的理论意义 2.我还是推测,你说的能量和文献差别很大,是不是你没有换算单位,要知道,文献中所使用的是kcal.mol-1,而我们计算得到的是a.u.,需要进行换算 发自小木虫Android客户端 |
4楼2016-02-18 11:21:08















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