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汕头大学海洋科学接受调剂
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浅游学术海

新虫 (初入文坛)

[求助] 怎样能得到watertip3p.pdb文件,请大神指教。 已有1人参与

想用pymol生成需要模拟的水蒸汽的初始结构,现在缺少watertip3p.pdb文件,请知道的大神指导一下。
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tang_wei

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
浅游学术海: 金币+10, 谢谢你的回答,我现在想找到直接的watertip3p.pdb文件,导入pymol中生成waterbox.pdb,然后输入到VMD中 2016-01-13 11:04:45
在MS里面建立一个H2O分在Discovery 运行的时候有一个type可以分配自己的模型原子类型
如图:http://pan.baidu.com/s/1botuoxx
2楼2016-01-12 18:44:37
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