24小时热门版块排行榜    

查看: 1803  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

sys_gintama

金虫 (小有名气)

[求助] [求助]径向分布函数问题 已有3人参与

前辈们好!我在用Towhee做气液平衡后,对液相进行了径向分布函数的计算。但是发现纵坐标趋近于0,而不是1,请问大家知道这是什么原因么?谢谢大家!

[求助]径向分布函数问题
water-H-H径向分布函数.png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

有些事情,只是想,一定不能成功;尝试去做,有可能成功。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sys_gintama

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 凌云志123 at 2016-01-05 10:36:20
这是我计算的  我用VASP ,你检查下体积和温度  还有截断半径

H-H RDF

谢谢您!我看了一下咱俩的图,发现r=2附近图像比较类似.您画图时采用的输入文件是什么类型的啊?pdb文件么?
有些事情,只是想,一定不能成功;尝试去做,有可能成功。
5楼2016-01-05 12:27:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
sys_gintama: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-03-13 12:28:25
你这个结果应该是有问题的,首先,我见过的水分子的H-H径向分布函数不是这样的,其次,你检查一下你的边界条件看看是不是周期边界,因为我最近发现不同的边界条件对径向分布函数是有影响的,至于原因还没有整明白!你可以参考一下《The Art of Molecular Dynamics Simulation》的第八章,里面是TIP4P 模拟的水分子的径向分布函数,你要使用软件做的话我就不太清楚问题出现在什么地方。但这个结果应该是有问题的。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2016-01-04 14:28:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌云志123

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这是我计算的  我用VASP ,你检查下体积和温度  还有截断半径
[求助]径向分布函数问题-1
H-H RDF

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2016-01-05 10:36:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sys_gintama

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by chuntao118 at 2016-01-04 14:28:31
你这个结果应该是有问题的,首先,我见过的水分子的H-H径向分布函数不是这样的,其次,你检查一下你的边界条件看看是不是周期边界,因为我最近发现不同的边界条件对径向分布函数是有影响的,至于原因还没有整明白! ...

谢谢您!我已經通过邮件联系您了
有些事情,只是想,一定不能成功;尝试去做,有可能成功。
4楼2016-01-05 12:24:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 271求调剂 +6 生如夏花… 2026-03-22 6/300 2026-03-26 16:48 by 张凯十八号
[考研] 312求调剂 +5 上岸吧ZJY 2026-03-22 9/450 2026-03-26 16:44 by 上岸吧ZJY
[考研] 352求调剂 +4 大米饭! 2026-03-22 4/200 2026-03-26 16:40 by 不吃魚的貓
[考研] 085601求调剂总分293英一数二 +4 钢铁大炮 2026-03-24 4/200 2026-03-26 16:28 by dick_runner
[考研] 考研调剂 +8 小蜡新笔 2026-03-26 8/400 2026-03-26 16:18 by dick_runner
[考研] 考研调剂 +7 呼呼?~+123456 2026-03-24 7/350 2026-03-26 15:24 by 小小麦片
[硕博家园] 北京林业大学硕导招生广告 +5 kongweilin 2026-03-26 7/350 2026-03-26 14:37 by mapenggao
[考研] 一志愿河工大 081700 276求调剂 +4 地球绕着太阳转 2026-03-23 4/200 2026-03-26 14:27 by zzll406
[考研] 296求调剂 +5 www_q 2026-03-20 5/250 2026-03-26 12:56 by 3Strings
[考研] 309求调剂 +4 gajsj 2026-03-25 5/250 2026-03-26 00:27 by Dyhoer
[考研] 机械学硕总分317求调剂!!!! +4 Acaciad 2026-03-25 4/200 2026-03-25 19:59 by hanserlol
[考研] 286求调剂 +11 Faune 2026-03-21 11/550 2026-03-25 10:11 by 雾散后相遇lc
[考研] 318求调剂 +5 plum李子 2026-03-21 8/400 2026-03-25 09:26 by aa331100
[考研] 080500求调剂 +3 zzzzfan 2026-03-24 3/150 2026-03-24 16:38 by barlinike
[考研] 277分求调剂,跨调材料 +3 考研调剂lxh 2026-03-24 3/150 2026-03-24 13:52 by JourneyLucky
[考研] 一志愿山东大学药学学硕求调剂 +3 开开心心没烦恼 2026-03-23 4/200 2026-03-24 00:06 by 开开心心没烦恼
[考研] 275求调剂 +6 shansx 2026-03-22 8/400 2026-03-22 15:27 by barlinike
[考研] 求助 +5 梦里的无言 2026-03-21 6/300 2026-03-21 17:51 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 353求调剂 +3 拉钩不许变 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:56 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见