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双酶切很近的酶切位点,总是切不成功,如何解决? 已有6人参与
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实验需要将已有的载体进行双酶切,再插入一段片段。 由于只能插入到多克隆位点上,所以酶切位点的选择有限,只能选择靠得很近的两个酶切位点,序列是: GACGTCGGATCCGAATTCGGTACC 需要切的是GACGTC(Aat II)和GGTACC(Kpn I) 之前用的TAKARA的酶,由于Buffer不同,分步酶切,但是效率一直很低,得不到最终的双酶切。 后来用NEB的酶,使用的是Aat II 和 Kpn I HF快切酶。 然后回收(回收浓度也非常低,0.004~0.015(ug/ul)之间),与目的片段连接。 由于插入片段的目的是为了破坏氨苄的抗性,同时载体本身具有卡纳的抗性。 所以转化之后,先用卡纳平板筛选, 挑斑到卡纳液体LB中,摇浑后再取部分在amp液体LB中培养,想着amp不浑浊的就是插入了片段的。 可是挑了几十个斑,都是两种抗性都有,随机挑了两个进行测序,发现目的片段压根就没有插入。 中间换了新酶切后的插入片段进行连接,仍然没有成功。 又做了一次双酶切,回收条带也非常浅。 是要再多次做一下双酶切嘛?(因为第一次有六个载体同时做双酶切,但是又试了两个进行连接,也都没有连接上) 不知道有什么方法可以更好地进行双酶切? 求大神醍醐灌顶。。。 |
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tiaojihaizi
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