24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 4958  |  回复: 20
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

siyuansing

银虫 (小有名气)

[求助] 加了酶切位点的引物扩增不出目的片段已有6人参与

扩增一个800bp的片段,引物的5‘端不加酶切位点就能扩增出来,加了酶切位点就扩增不出来是什么情况?
如图,从左向右依次是marker、无酶切位点的引物、有酶切位点的引物、有酶切位点和保护碱基的引物
引物列表如下
上引物无酶切位点:GTACAGACAAGAAACGCGTCA
下引物无酶切位点:TGGGAAGAAGACAGAGCTCTG

上引物+酶切位点:AAGCTTGTACAGACAAGAAACGCGTCA
下引物+酶切位点:CCTGCAGGTGGGAAGAAGACAGAGCTCTG

上引物+酶切位点+保护碱基:GGCAAGCTTGTACAGACAAGAAACGCGTCA
下引物+酶切位点+保护碱基:AAAACCTGCAGGTGGGAAGAAGACAGAGCTCTG
以上引物都是从5’端→3'端

后来实在扩增不出来,放弃前段300bp,在该800bp片段扩增后面500bp,改变上引物、保留下引物,依然是只有无酶切位点才能扩增的出来,加了酶切位点以后就扩增不出来。这个问题困扰了半个月了,求大神解救,万分感激。

加了酶切位点的引物扩增不出目的片段
PC 2015-12-06 12 时 40 分 土曲霉pdc启动子.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mpa104

新虫 (初入文坛)

这个应该不难扩增,主要问题 在于设计引物的时候加了酶切位点之后的退火,要尽量接近,至于用什么taq酶,个人感觉无所谓
15楼2015-12-14 15:46:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 21 个回答

lutu2013

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
建议用 takara 的primeSTAR MAX做PCR   一般都可以跑出来
2楼2015-12-13 14:43:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shanyue00

铁杆木虫 (著名写手)

耐心说话,好好说话!
3楼2015-12-13 18:15:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
4楼2015-12-13 18:21:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见