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精神的飞行者

新虫 (小有名气)

[求助] 重金求助!广州超算VASP5.3磁性计算报错!已有4人参与

大家好!

       最近我们在广州超算天河二号上安装了VASP5.3,发现比天津超算天河一号速度快,开心不久却发现只要一做spin polarized计算就会报错,然后自动停止。求助大家,是否有类似的经历,相信有很多朋友也在广州超算上用VASP的吧,你们有遇到类似的问题吗,怎么解决的?
       spin polarized计算报错如下,slurm文件里读出来的,自洽计算刚开始就报错停止了:

LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew
found WAVECAR, reading the header
  number of bands has changed, file:   564 present:   670
  trying to continue reading WAVECAR, but it might fail
POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: small aliasing (wrap around) errors must be expected
FFT: planning ...
reading WAVECAR
random initialization beyond band          565
the WAVECAR file was read successfully
No down-spin wavefunctions found --> setting down-spin equal up-spin ...
charge-density read from file: MoS2
magnetization density of overlapping atoms calculated
entering main loop
       N       E                     dE             d eps       ncg     rms          rms(c)
Error EDDDAV: Call to ZHEGV failed. Returncode =   9 2  16

       我们用的是系统中的ifort14和配套的mpi进行编译的,fft数学库用的也是intel mkl的。不做磁性的计算没有问题,但是只要开始做磁性的计算就会报错。
       谢谢大家,金币什么的都好说哈!
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精神的飞行者

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 青-歌 at 2015-12-10 13:00:55
最近我也打算在天河二号编译VASP,楼主能否分享一下您的makefile文件?十分感谢!也希望您的问题能够早日解决!

我这里准备贴出Makefile的时候小木虫系统提示有敏感词,唉。
5楼2015-12-11 09:47:44
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精神的飞行者

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 青-歌 at 2015-12-10 13:00:55
最近我也打算在天河二号编译VASP,楼主能否分享一下您的makefile文件?十分感谢!也希望您的问题能够早日解决!

这是我在广州天河二号上编辑的Makefile文件,使用ifort和配套的mpi,还有mkl的fft数学库。大家看看安装过程有没什么问题,我安装时候没有发现报错。

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  • 附件 1 : Makefile_GZ
  • 2015-12-11 09:50:08, 16.62 K
6楼2015-12-11 09:51:09
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普通回帖

青-歌

铜虫 (初入文坛)

最近我也打算在天河二号编译VASP,楼主能否分享一下您的makefile文件?十分感谢!也希望您的问题能够早日解决!
2楼2015-12-10 13:00:55
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luzihen

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-12-12 13:37:59
IALGO=48试一下
我之前也是,加了这个以后再少点k点就算起来了

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2015-12-11 02:18:49
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精神的飞行者

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by luzihen at 2015-12-11 02:18:49
IALGO=48试一下
我之前也是,加了这个以后再少点k点就算起来了

谢谢,但是我试了一下IALGO和减少K点发现仍然报错,报错信息也和之前是一样的。你也是在广州天河二号上发现同样问题的吗?我感觉和计算机集群的环境有关,因为同样的软件,使用的安装方法也一样,天津上做计算就没问题。
4楼2015-12-11 09:33:25
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青-歌

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 精神的飞行者 at 2015-12-11 09:47:44
我这里准备贴出Makefile的时候小木虫系统提示有敏感词,唉。...

感谢分享!
7楼2015-12-11 11:18:05
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精神的飞行者

新虫 (小有名气)

另外还想问一下,用天河二号的朋友,你们怎么从目录里下载文件到本地?速度多快?我这边6M的带宽但是下载时候每秒只有几个K!
8楼2015-12-11 16:03:35
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青-歌

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 精神的飞行者 at 2015-12-11 16:03:35
另外还想问一下,用天河二号的朋友,你们怎么从目录里下载文件到本地?速度多快?我这边6M的带宽但是下载时候每秒只有几个K!

登陆sslVPN有两个IP地址,一个是电信网的,一个是教育网的,哪个速度慢可以换一个试试。另外先用tar打包再下载似乎可以加速。这些在天河二号的简明使用手册里都有说明。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

9楼2015-12-13 06:51:54
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xiewuhua

木虫 (正式写手)

我认为是你编译的VASP版本可能有问题,试试编译VASP 5.3.3.full版本

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

10楼2015-12-13 07:53:08
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