应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 用mothur做植物内生真菌基因库的OTU聚类分析，提示片段长度不一致，怎么办？
51/1返回列表
查看: 2421  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

wcq吴超群

新虫 (小有名气)

[求助] 用mothur做植物内生真菌基因库的OTU聚类分析，提示片段长度不一致，怎么办？ 已有1人参与

最近测了一种植物的内生真菌序列的克隆文库，大概有一百多条序列，长度在500-750bp之间都有。想用mothur软件把这些序列划分到不同的OTU，然后再挑选每个OTU中代表序列做系统发育分析。那么问题来了？
    我在运行mothur软件时，提醒序列长度不一致，需要修改成一致的。请问这个是什么意思？难道要把序列长度都人工截取到一样的长度？
    我发现mega软件在构建系统发育树时也有一个步骤是处理每个序列使它们的长度保持一致后，才能构建树。
本人纯属小白，还请各位多多帮助。ps有没有其他的方法或软件把克隆文库的序列划分到不同的OTU，我在网上只能查到mothur的教程比较详细。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2015-12-09 10:29:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

喝茶的面包

银虫 (初入文坛)
最近在学mothur，也遇到和楼主相同的问题，请问您解决了吗？如果解决了，能否告知是怎样解决的，非常感谢
赞一下 回复此楼
3楼2015-12-29 18:51:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

wcq吴超群

新虫 (小有名气)
顶

发自小木虫Android客户端
2楼2015-12-09 12:05:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wcq吴超群

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 喝茶的面包 at 2015-12-29 18:51:34
最近在学mothur，也遇到和楼主相同的问题，请问您解决了吗？如果解决了，能否告知是怎样解决的，非常感谢

mega软件在构建系统发育树时也有一个步骤是处理每个序列使它们的长度保持一致后，才能构建树。我就用MEGA软件把他们长度处理一致后，再在mothur上运行

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2015-12-30 08:44:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

苹果苹果梨

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我mothur 下载后出现编码对话框怎么回事啊 下一步我该怎么办
赞一下 回复此楼
5楼2016-01-12 14:09:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] filecode +10 documentary 2026-08-10 11/550 2026-08-12 12:21 by 且听虎啸
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +20 Lanmanbaby 2026-08-09 33/1650 2026-08-12 11:26 by lantianda
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[硕博家园] 读博的好处 +3 lnee 2026-08-11 3/150 2026-08-11 18:10 by 希望我好好的
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] 确定了，国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +3 majunge000 2026-08-10 3/150 2026-08-10 15:46 by lch2012
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读？ +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭