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mofashishe

铜虫 (小有名气)

[交流] 5' RACE 的问题。。。

使用 clonetech的BD SMART 试剂盒扩几个线虫基因的5‘序列。
但是测序回来的结果都是NUP的单引物扩增。
反转录的时候用的是PrimeScript Reverse Transcriptase (RNase H-)。
体系:
RNA:3ul
SMART oligoII:1ul
5’ CDS primer:1ul
buffer:2ul
DTT(100mM):0.25ul
dNTP(10mM):1ul
RTase:0.5ul
DEPC 水 to 10ul。

方法都是按照说明书所叙70度变性,再冰浴的,再42度反应1小时。

在做第一、二轮PCR时都做了退火温度从62度-70度的梯度,但是测序回来4个基因的结果都是NUP的单引物扩增。

请各位指教指教。。。。。

[ Last edited by mofashishe on 2008-9-20 at 10:38 ]
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