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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 关于种群历史动态（demography）
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zhoutianhe

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于种群历史动态（demography） 已有1人参与

大家好！请问计算种群历史动态时是用所有的序列还是只用单倍型序列呢？
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1楼 2015-12-03 09:34:58
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jiaobingke

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

PSMC，MSMC，smc++类的软件只能接收二倍体数据，不能接收单倍体数据。stairway plot软件的文章中以人类重测序数据为例，也是接收二倍体数据。但是计算频谱应该可以用单倍体的数据。其他做种群动态史的软件因为基本原理可能不同，能否接收单倍体数据需要看软件的说明书。
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知过能改，善莫大焉
2楼2020-06-24 09:21:50
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