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zhoutianhe

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于种群历史动态(demography) 已有1人参与

大家好!请问计算种群历史动态时是用所有的序列还是只用单倍型序列呢?
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jiaobingke

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

PSMC,MSMC,smc++类的软件只能接收二倍体数据,不能接收单倍体数据。stairway plot软件的文章中以人类重测序数据为例,也是接收二倍体数据。但是计算频谱应该可以用单倍体的数据。其他做种群动态史的软件因为基本原理可能不同,能否接收单倍体数据需要看软件的说明书。
知过能改,善莫大焉
2楼2020-06-24 09:21:50
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