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鬼斗1990

金虫 (小有名气)

[求助] MS模拟中的一些问题,望大神帮帮忙!

我在用MS做环氧树脂的交联反应,先是建立一个AC盒子,在里面放入反应物,然后,我自己手动交联之后,需要在这个交联体系中放入一些有害物质的小分子,但是在AC的construction模块中,无法加入这个交联体系,所以,我就没有办法将小分子放入到聚合体中,求各位大神帮忙解答!谢谢各位了!
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

引用回帖:
8楼: Originally posted by 鬼斗1990 at 2015-12-01 21:18:36
大神,帮我看看,这是我点了yes之后的结果,也就是我的操做失败的原因,我是新手,知道的太少了,问了这么多,麻烦了,谢谢

LZA3OL96QJ5Y@8UO4EUHQOI.png
...

错误描述很简单,你的BPA分子加不进AC胞里面

可能原因有几个:
100000步数太少
AC胞内的空隙太小塞不进BPA分子
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
9楼2015-12-02 08:20:46
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流 2015-11-26 14:29:00
ac的功能主要是把没晶胞的小分子组合到一起放到一个晶胞,你的聚合物已经在盒子里了,所以不能作为ac task的输入文件

2种方法
adsorption locator,可以在晶胞中直接添加小分子
聚合物盒子把聚合物链复制出来做个新的xsd,新的xsd和小分子xsd作为ac task的输入文件
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2015-11-25 16:48:28
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鬼斗1990

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2015-11-25 16:48:28
ac的功能主要是把没晶胞的小分子组合到一起放到一个晶胞,你的聚合物已经在盒子里了,所以不能作为ac task的输入文件

2种方法
adsorption locator,可以在晶胞中直接添加小分子
聚合物盒子把聚合物链复制出来做 ...

大神!你说的以上的方法都必须是这个交联体系是一个整体,然而,我在进行交联反应时,整个AC盒子里面它是没有办法成为一个整体的,它是有一些长链,中短链组合而成的,如果是这样,那该怎么往这个体系中添加另外的小分子?
谢谢大神的帮忙!
3楼2015-11-26 09:26:28
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鬼斗1990

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2015-11-25 16:48:28
ac的功能主要是把没晶胞的小分子组合到一起放到一个晶胞,你的聚合物已经在盒子里了,所以不能作为ac task的输入文件

2种方法
adsorption locator,可以在晶胞中直接添加小分子
聚合物盒子把聚合物链复制出来做 ...

大神!你说的以上的方法都必须是这个交联体系是一个整体,然而,我在进行交联反应时,整个AC盒子里面它是没有办法成为一个整体的,它是有一些长链,中短链组合而成的,如果是这样,那该怎么往这个体系中添加另外的小分子?
谢谢大神的帮忙!
4楼2015-11-26 09:26:39
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