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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » Siesta结构优化时出现 Error in Cholesky factorisation in cdiag
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oranges

铁虫 (初入文坛)

[求助] Siesta结构优化时出现 Error in Cholesky factorisation in cdiag 已有1人参与

大家好，我在用Siesta做结构优化时，有时候在运行了几十步或上百步后会出现 Error in Cholesky factorisation in cdiag错误。若将出错时的结构取出继续优化，有可能会再次出错。大概这样子接了几次后才能正常结束优化。请问这是什么问题啊？是需要加什么参数，还是LAPACK库有问题？
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1楼 2015-11-21 12:08:28
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zhangguangping

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2015-11-22 16:13:02
oranges: 金币+5 2015-11-26 10:07:38
oranges: 金币+5, ★★★很有帮助 2015-11-26 10:07:48
这个时候一般考虑检查结构是否合理。是否存在两个原子太近（可能是原子坐标单位指定错误了）。
如果不是这个原因，那就检查体系的晶格矢量是否指定合理。因为太小的晶格矢量，可能会使得体系的原子跟临近的镜像原胞中的原子靠的很近。
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弘德明志博学笃行
2楼2015-11-22 15:44:42
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oranges

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangguangping at 2015-11-22 15:44:42
这个时候一般考虑检查结构是否合理。是否存在两个原子太近（可能是原子坐标单位指定错误了）。
如果不是这个原因，那就检查体系的晶格矢量是否指定合理。因为太小的晶格矢量，可能会使得体系的原子跟临近的镜像原胞 ...

呃，我已检查过了，确定并没有原子离得太近。还有可能是其他的原因么？
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3楼2015-11-25 16:26:12
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zhangguangping

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by oranges at 2015-11-25 16:26:12
呃，我已检查过了，确定并没有原子离得太近。还有可能是其他的原因么？...

我没有遇到过别的情况的时候。遇到这个问题的时候，就是这个问题导致的。
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弘德明志博学笃行
4楼2015-11-25 18:38:07
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