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hongsemenghuan

木虫 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-10-27 10:56:16
你扫描角312的目的是什么?可否用342代替?...

不能代替啊,我这个问题不局限于图中的角度。应该具有一般性的
11楼2015-10-27 15:18:42
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virtualzx

木虫 (著名写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by hongsemenghuan at 2015-10-27 15:18:42
不能代替啊,我这个问题不局限于图中的角度。应该具有一般性的...

虚原子本身是假想的辅助原子,而势能面只是真实原子坐标的函数,虚原子坐标不是它的自变量。移动虚原子,所有物理量都不变,所以你扫描时所有能量变化都是实原子移动导致的,和虚原子无关

虚原子存在的唯一目的是辅助实原子的定义,一般用在线性分子等坐标定义困难的情况。

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12楼2015-10-27 18:40:00
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yejunge

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-10-27 08:00:15
nh 1.0 S 10 0.2
hcc 90.0 S 10 2.0
你的这块,我是没这样写过,不知道这种写法正确不正确
一般正确的写法应该是:
B 2 4 1.0 S 10 0.1
A 3 1 2 90.0 S 10 2.0
虚原子原本就是仅仅用来辅助结构的,我不认为这 ...

虚原子不能为1号原子?为什么呢,我看网上的贴子说也不能放最后,那怎么办

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13楼2015-10-27 22:32:40
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yejunge

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
12楼: Originally posted by virtualzx at 2015-10-27 18:40:00
虚原子本身是假想的辅助原子,而势能面只是真实原子坐标的函数,虚原子坐标不是它的自变量。移动虚原子,所有物理量都不变,所以你扫描时所有能量变化都是实原子移动导致的,和虚原子无关
虚原子存在的唯一目的是辅 ...

线性坐标,那我把它改为Bq原子行么?我也想研究需原子,可是怎么扫描都不对

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14楼2015-10-27 22:36:31
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virtualzx

木虫 (著名写手)

引用回帖:
14楼: Originally posted by yejunge at 2015-10-27 22:36:31
线性坐标,那我把它改为Bq原子行么?我也想研究需原子,可是怎么扫描都不对
...

不要用Bq。你的完整z矩阵定义是什么?

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15楼2015-10-28 00:01:54
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
13楼: Originally posted by yejunge at 2015-10-27 22:32:40
虚原子不能为1号原子?为什么呢,我看网上的贴子说也不能放最后,那怎么办
...

可以对所有原子重新编号?
16楼2015-10-28 07:20:25
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by hongsemenghuan at 2015-10-27 15:18:42
不能代替啊,我这个问题不局限于图中的角度。应该具有一般性的...

那把你的问题说出来,集思广益,可能比你自己想出来的办法更加有效
17楼2015-10-28 07:21:03
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hongsemenghuan

木虫 (著名写手)

引用回帖:
17楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-10-28 07:21:03
那把你的问题说出来,集思广益,可能比你自己想出来的办法更加有效...

我是在重复文献上的势能面,它的角度变化就是两个实原子中点和另外一个实原子连线与前两个实原子之间的键角的变化。我不知道这个角度该怎么表示,就想到了虚原子。有什么好办法吗?
关于添加虚拟原子扫描势能面的问题
IMG_20151028_081053.jpg

18楼2015-10-28 08:15:01
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
18楼: Originally posted by hongsemenghuan at 2015-10-28 08:15:01
我是在重复文献上的势能面,它的角度变化就是两个实原子中点和另外一个实原子连线与前两个实原子之间的键角的变化。我不知道这个角度该怎么表示,就想到了虚原子。有什么好办法吗?

IMG_20151028_081053.jpg
...

也就是说,上面那个原子的移动轨迹是个扇形?
如果在成键中心加虚原子,因为键长会变,但是虚原子的位置不变,键长变了之后虚原子就不在中心了。。。
19楼2015-10-28 12:28:24
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hongsemenghuan

木虫 (著名写手)

引用回帖:
19楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-10-28 12:28:24
也就是说,上面那个原子的移动轨迹是个扇形?
如果在成键中心加虚原子,因为键长会变,但是虚原子的位置不变,键长变了之后虚原子就不在中心了。。。...

那这个问题需要怎么做才行得通呢?高手指教!
20楼2015-10-28 16:13:58
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