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lucky1119

新虫 (初入文坛)

[求助] 小分子能量最小化方法

我做的是蛋白质-配体对接,想知使配体能量最小化的方法……我用chem3D中的MM,可老板说没依据,怎么办?是不是还要构想搜索?具体怎么做?求指教

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lucky1119

新虫 (初入文坛)

用chemdraw3d中的mm2,找相关理论来证明即可,使分子能量最小化的方法有最速下降法和共轭梯度法,建议你去查相关资料看看,另外mm2里用的相关算法也去看看

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6楼2015-11-09 23:02:00
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)


【答案】应助回帖

小分子能量最小化即可,不行的话就MM94和分子动力学都用上
2楼2015-10-28 14:50:59
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lucky1119

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2015-10-28 14:50:59
小分子能量最小化即可,不行的话就MM94和分子动力学都用上

嗯嗯,谢谢你,我想知道用MM2如何判定它就是最小化的呢?

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3楼2015-10-28 23:39:34
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lucky1119

新虫 (初入文坛)

4楼2015-10-30 21:44:15
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