24小时热门版块排行榜    

查看: 4311  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lucky1119

新虫 (初入文坛)

[求助] 小分子能量最小化方法

我做的是蛋白质-配体对接,想知使配体能量最小化的方法……我用chem3D中的MM,可老板说没依据,怎么办?是不是还要构想搜索?具体怎么做?求指教

发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lucky1119

新虫 (初入文坛)

用chemdraw3d中的mm2,找相关理论来证明即可,使分子能量最小化的方法有最速下降法和共轭梯度法,建议你去查相关资料看看,另外mm2里用的相关算法也去看看

发自小木虫Android客户端
6楼2015-11-09 23:02:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

pymol

捐助贵宾 (正式写手)


【答案】应助回帖

小分子能量最小化即可,不行的话就MM94和分子动力学都用上
2楼2015-10-28 14:50:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lucky1119

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2015-10-28 14:50:59
小分子能量最小化即可,不行的话就MM94和分子动力学都用上

嗯嗯,谢谢你,我想知道用MM2如何判定它就是最小化的呢?

发自小木虫Android客户端
3楼2015-10-28 23:39:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lucky1119

新虫 (初入文坛)

4楼2015-10-30 21:44:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +11 archvillain 2026-08-15 20/1000 2026-08-15 17:47 by 医学老男孩
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +7 Ldrop2023 2026-08-13 7/350 2026-08-15 15:57 by mzhh2000
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 15:10 by QXtWNz7PI7wZ
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 14:58 by QXtWNz7PI7wZ
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 07:09 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] filecode +7 cratir 2026-08-14 11/550 2026-08-15 06:19 by 学员8dgXkO
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 7lpolszZVXgi 2026-08-14 5/250 2026-08-15 04:41 by 4wMiSEwB6436
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 4/200 2026-08-15 04:17 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-14 22:32 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
信息提示
请填处理意见