应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 网络生活区 » 有奖问答 » 实验讨论 » 小分子能量最小化方法
61/1返回列表
查看: 4313  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lucky1119

新虫 (初入文坛)

[求助] 小分子能量最小化方法

我做的是蛋白质-配体对接，想知使配体能量最小化的方法……我用chem3D中的MM,可老板说没依据，怎么办？是不是还要构想搜索？具体怎么做？求指教

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2015-10-24 17:29:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

小分子能量最小化即可，不行的话就MM94和分子动力学都用上
赞一下 回复此楼
2楼2015-10-28 14:50:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lucky1119

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2015-10-28 14:50:59
小分子能量最小化即可，不行的话就MM94和分子动力学都用上

嗯嗯，谢谢你，我想知道用MM2如何判定它就是最小化的呢？

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2015-10-28 23:39:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lucky1119

新虫 (初入文坛)
问题已解决，谢谢大家

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2015-10-30 21:44:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

精业济群

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by lucky1119 at 2015-10-30 21:44:15
问题已解决，谢谢大家

简单的chemdraw 3D能量最小化感觉不准确，有时优化的分子构象完全不是优势构象，求教楼主怎么解决的或者合理的解释，谢谢！
赞一下 回复此楼
加油！！！！
5楼2015-11-09 19:26:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lucky1119

新虫 (初入文坛)
用chemdraw3d中的mm2,找相关理论来证明即可，使分子能量最小化的方法有最速下降法和共轭梯度法，建议你去查相关资料看看，另外mm2里用的相关算法也去看看

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2015-11-09 23:02:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lucky1119 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +8 majunge000 2026-08-11 10/500 2026-08-15 18:55 by Equinoxhua
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +3 wangze12014 2026-08-14 4/200 2026-08-15 18:05 by babangida
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +27 医学老男孩 2026-08-13 58/2900 2026-08-15 15:57 by GZUZM
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] FileCode能看出啥？ +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 确定了，国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭