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308866814

新虫 (初入文坛)

[求助] 求大神帮忙分析下DS的对接结果,跪求 已有1人参与

小弟刚自学的Discovery studio,用Libdock做的蛋白和多酚化合物的对接,用2D视图保存了结果,但不会分析,求各位大神不吝赐教,另小弟做的是淀粉样蛋白方面的研究,有类似课题的可以相互交流学习哈。谢谢了
小弟不理解各种颜色的残基代表什么,还有ds可以模拟出疏水相互作用吗?为什么我的结果中没有显示,谢谢啦。

求大神帮忙分析下DS的对接结果,跪求


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a86052

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
不同颜色的氨基酸残基具体含义在help文件里有,例如附件里所示。疏水作用如何显示就不清楚了

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  • 附件 1 : 1.jpg
  • 2015-10-13 11:09:45, 133.16 K
3楼2015-10-13 11:10:12
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308866814

新虫 (初入文坛)

2楼2015-10-13 10:32:47
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308866814

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by a86052 at 2015-10-13 11:10:12
不同颜色的氨基酸残基具体含义在help文件里有,例如附件里所示。疏水作用如何显示就不清楚了

谢谢,是不是在2d图中显示出来的氨基酸残基均与小分子配体有相互作用?那残基和配体之间的相互作用有范德华力,氢键,极性相互作用,静电相互作用吧,不知道我分析的对不对,请指正,谢谢!

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4楼2015-10-13 16:09:34
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weichen

新虫 (小有名气)

能问一下你怎么保存的二维视图吗?
5楼2016-09-17 19:16:22
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