24小时热门版块排行榜    

查看: 1682  |  回复: 6

lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】

[求助] 谁能给出一个oniom的输入文件 已有2人参与

想学一下ONIOM但是不知改怎么写输入文件,一头雾水,也不知道如何分层。
谁能给个ONIOM的.gjf文件,谢谢。

发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hakuna

木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lastzealot: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-10-02 23:48:32
手册上说的很清楚啊:http://www.gaussian.com/g_whitepap/oniom_technote.htm
如果想看看GV里怎么做,这里有说明:
http://wenku.baidu.com/link?url= ... 7XhRj1oppXvaOCX1eL3

或者你在百度文库里搜一下“用Gview设定Oniom方法的具体步骤”
2楼2015-10-02 11:45:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
3楼2015-10-02 11:55:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jimsmart

捐助贵宾 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lastzealot: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 非常感谢 2015-10-02 23:48:52
# oniom(b3lyp/6-31g(d,p):uff) opt  
  
2-layer oniom optimization
  
0 1 0 1 0 1
  f        -1.041506214819      0.000000000000     -2.126109488809 m
  f        -2.033681935634     -1.142892069126     -0.412218766901 m
  f        -2.033681935634      1.142892069126     -0.412218766901 m
  c        -1.299038105677      0.000000000000     -0.750000000000 m h 5
  c         0.000000000000      0.000000000000      0.000000000000 h
  h         0.000000000000      0.000000000000      1.100000000000 h
  o         1.125833024920      0.000000000000     -0.650000000000 h
4楼2015-10-02 20:25:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】

引用回帖:
4楼: Originally posted by jimsmart at 2015-10-02 20:25:59
# oniom(b3lyp/6-31g(d,p):uff) opt  
  
2-layer oniom optimization
  
0 1 0 1 0 1
  f        -1.041506214819      0.000000000000     -2.126109488809 m
  f        -2.033681935634     -1.142892 ...

请问010101以及下面的f和数字都代表什么呀?
另外,
谢谢 oniom计算关键词中可以用gen pseudo=read等关键词吗?
谢谢

发自小木虫Android客户端
5楼2015-10-03 00:35:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】

引用回帖:
2楼: Originally posted by hakuna at 2015-10-02 11:45:50
手册上说的很清楚啊:http://www.gaussian.com/g_whitepap/oniom_technote.htm
如果想看看GV里怎么做,这里有说明:
http://wenku.baidu.com/link?url=186lr6LsnmMxcMwcvsr7YeyjtI6CCwn4xbUlWmJTkmlzodLk36uJ9rWz ...

请问oniom计算中可用gen pseudo=read关键词吗?如果可以,需要如何来书写呢?
谢谢

发自小木虫Android客户端
6楼2015-10-03 00:37:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

那年·时光飞

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by jimsmart at 2015-10-02 20:25:59
# oniom(b3lyp/6-31g(d,p):uff) opt  
  
2-layer oniom optimization
  
0 1 0 1 0 1
  f        -1.041506214819      0.000000000000     -2.126109488809 m
  f        -2.033681935634     -1.142892 ...

我想请教一下  要是多分子分层的话,中间没有链接原子  在输入文件里加入oniom=embedcharge  这样对吗? 我算出来结果总是103错误,是构型的原因吗
7楼2015-10-24 09:41:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lastzealot 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 7K1CJE38xLG4 2026-08-25 5/250 2026-08-26 07:17 by cNXvBfCpiZOM
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 Qj98d49dHFb9 2026-08-25 5/250 2026-08-26 04:57 by cNXvBfCpiZOM
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 7K1CJE38xLG4 2026-08-25 4/200 2026-08-26 02:04 by cNXvBfCpiZOM
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +18 angus9576 2026-08-25 22/1100 2026-08-26 00:41 by merchancy
[基金申请] 有没有大神帮我看看基金代码 28+4 1234567wang 2026-08-24 10/500 2026-08-25 19:15 by lfy8008
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 19/950 2026-08-25 17:57 by chick875
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +5 process2012 2026-08-23 7/350 2026-08-25 09:42 by huixian257
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +17 kkkl_v 2026-08-19 18/900 2026-08-25 09:41 by windflowerwy
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +25 yaoyewhu2008 2026-08-20 27/1350 2026-08-25 08:01 by Equinoxhua
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见