应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 药物分析 » 【UPLC-Q-TOF-MS/MS代谢组学数据处理分析】的疑惑
51/1返回列表
查看: 1521  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

rainfans1

新虫 (初入文坛)

[交流] 【UPLC-Q-TOF-MS/MS代谢组学数据处理分析】的疑惑 已有3人参与

最近做一个中药坠痰下气的代谢组学研究，出来了一大堆数据，完全自己摸索，遇到很多问题，想拿出来分享一下，顺便请求下帮助！数据处理详情如下：
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2015-09-22 15:30:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fuwanqin

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
看SIMICA-1，选绝对值大于0.9的，，s-plot图中选相差较远的，完成筛选，然后回到结果表，全选，右键搜库
赞一下 回复此楼
7楼2015-09-24 15:05:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

rainfans1

新虫 (初入文坛)
Scaling 模式默认的为UV模式。选择Pareto  进行OPLS-DA分析  得到一下图表
【UPLC-Q-TOF-MS/MS代谢组学数据处理分析】的疑惑
1.png


【UPLC-Q-TOF-MS/MS代谢组学数据处理分析】的疑惑-1
2.png


【UPLC-Q-TOF-MS/MS代谢组学数据处理分析】的疑惑-2
3.png


【UPLC-Q-TOF-MS/MS代谢组学数据处理分析】的疑惑-3
4.png
赞一下 回复此楼
4楼2015-09-22 16:01:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rainfans1

新虫 (初入文坛)
VIP>1的数据有三百多个  选择>2的作为标记物
至此标记物第1轮筛选结束
然后问题来了
（1）Scaling  模式   软件默认UV模式 包括SIMCA-P也是。之前在网上下了MarkerLynx_XS 培训资料，说要选择Pareto模式。然后我发现这两个模式下的VIP值>2选出来的列表相差很大。
（2）很多筛选出来的MASS 值输入总离子流图查找该色谱峰，发现很多都不像要寻找的物质 很少有出来一个单峰 且二级质谱图干净的  
然后我想我的这个数据处理流程正不正确
赞一下 回复此楼
5楼2015-09-22 16:08:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rainfans1

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by fuwanqin at 2015-09-24 15:05:37
看SIMICA-1，选绝对值大于0.9的，，s-plot图中选相差较远的，完成筛选，然后回到结果表，全选，右键搜库

请问你懂那个score图里面的t[Comp.1]/t[Comp.2]是什么意思吗，一般做出来的X-Axis:Comp和Y-Axis:Comp都有几种，t[Comp.1]/t[Comp.2]是最重要的模式，选择其他的时候分离效果明显变化！
赞一下 回复此楼
8楼2015-09-27 16:25:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭