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kangaroo0513

新虫 (正式写手)

[求助] 超级短片段如何PCR或者其他方式引入载体?以及Cre/LoxP问题。。

1、目的片段66bp左右,两边打算加几个酶切位点,加好大约100bp,这个长度好尴尬。。怎么处理比较好?

最终打算做成这个样子(如图)
http://muchongimg.xmcimg.com/data/b ... _1442904607_413.png
其中,黄色对应某模板,蓝色的是我打算在引物两边加的酶切位点。。这个PCR回收效率似乎超级低是吧。。


2、Cre/LoxP系统中的loxP核心序列8bp可以是任意序列么?我知道两个loxP的核心序列要相同或者相反方向,只是这8bp是不是可以任意设计的?
(因为看到百度里这么说的:Cre不仅可以识别LoxP的2个13bp的反向重复序列和8bp的间隔区域,而且当一个13bp的反向重复序列或者8bp的间隔区发生改变时仍能识别并发生重组。利用这一特点,人们在构建载体时可以根据需要改造LoxP位点序列,以用于特定的基因突变或修复,增加了该系统的应用范围。)

3、据说Cre/loxP是可逆过程,那么,两个同向loxP之间的基因敲除的彻底么?两个反向LoxP之间的基因是不是可能被倒装后又正过来了?

超级短片段如何PCR或者其他方式引入载体?以及Cre/LoxP问题。。
xxxx.png
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高gaoeryang

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by kangaroo0513 at 2015-09-23 14:49:32
一直在用infusion,但是没试过这么短的片段。。短片段infusion你试过没?...

做过,IN-FUSION可以覆盖0.05-15kb的大小片段。
4楼2015-09-24 16:25:55
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高gaoeryang

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
PCR短片段可以尝试用IN-FUSION方法进行构建
2楼2015-09-23 14:20:37
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kangaroo0513

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 高gaoeryang at 2015-09-23 14:20:37
PCR短片段可以尝试用IN-FUSION方法进行构建

一直在用infusion,但是没试过这么短的片段。。短片段infusion你试过没?
3楼2015-09-23 14:49:32
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kangaroo0513

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 高gaoeryang at 2015-09-24 16:25:55
做过,IN-FUSION可以覆盖0.05-15kb的大小片段。...

你说的50bp指的是包括同源臂在内50bp还是不包括同源臂只是插入片段就至少要50bp?
5楼2015-09-25 12:46:06
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