24小时热门版块排行榜    

查看: 1901  |  回复: 10

kangaroo0513

新虫 (正式写手)

[求助] 超级短片段如何PCR或者其他方式引入载体?以及Cre/LoxP问题。。

1、目的片段66bp左右,两边打算加几个酶切位点,加好大约100bp,这个长度好尴尬。。怎么处理比较好?

最终打算做成这个样子(如图)
http://muchongimg.xmcimg.com/data/b ... _1442904607_413.png
其中,黄色对应某模板,蓝色的是我打算在引物两边加的酶切位点。。这个PCR回收效率似乎超级低是吧。。


2、Cre/LoxP系统中的loxP核心序列8bp可以是任意序列么?我知道两个loxP的核心序列要相同或者相反方向,只是这8bp是不是可以任意设计的?
(因为看到百度里这么说的:Cre不仅可以识别LoxP的2个13bp的反向重复序列和8bp的间隔区域,而且当一个13bp的反向重复序列或者8bp的间隔区发生改变时仍能识别并发生重组。利用这一特点,人们在构建载体时可以根据需要改造LoxP位点序列,以用于特定的基因突变或修复,增加了该系统的应用范围。)

3、据说Cre/loxP是可逆过程,那么,两个同向loxP之间的基因敲除的彻底么?两个反向LoxP之间的基因是不是可能被倒装后又正过来了?

超级短片段如何PCR或者其他方式引入载体?以及Cre/LoxP问题。。
xxxx.png
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

高gaoeryang

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
PCR短片段可以尝试用IN-FUSION方法进行构建
2楼2015-09-23 14:20:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kangaroo0513

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 高gaoeryang at 2015-09-23 14:20:37
PCR短片段可以尝试用IN-FUSION方法进行构建

一直在用infusion,但是没试过这么短的片段。。短片段infusion你试过没?
3楼2015-09-23 14:49:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

高gaoeryang

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by kangaroo0513 at 2015-09-23 14:49:32
一直在用infusion,但是没试过这么短的片段。。短片段infusion你试过没?...

做过,IN-FUSION可以覆盖0.05-15kb的大小片段。
4楼2015-09-24 16:25:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kangaroo0513

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 高gaoeryang at 2015-09-24 16:25:55
做过,IN-FUSION可以覆盖0.05-15kb的大小片段。...

你说的50bp指的是包括同源臂在内50bp还是不包括同源臂只是插入片段就至少要50bp?
5楼2015-09-25 12:46:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

DanceMacabre

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kangaroo0513: 金币+1, 有帮助, 神马叫100p?难道是pmol?以前做过crispr的退火后连接没成功。。555 2015-09-25 20:26:20
把序列加上酶切位点之后,直接合成。将正反向引物稀释成100P的浓度,各5ul,加水至15ul体系,沸水浴5min,至自然冷却。将载体双酶切,曝露出酶切位点,将退火引物与载体用连接酶连接即可

发自小木虫Android客户端
6楼2015-09-25 13:04:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

DanceMacabre

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by DanceMacabre at 2015-09-25 13:04:11
把序列加上酶切位点之后,直接合成。将正反向引物稀释成100P的浓度,各5ul,加水至15ul体系,沸水浴5min,至自然冷却。将载体双酶切,曝露出酶切位点,将退火引物与载体用连接酶连接即可
...

金币哦

发自小木虫Android客户端
7楼2015-09-25 13:26:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小米粒2015

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by kangaroo0513 at 2015-09-25 12:46:06
你说的50bp指的是包括同源臂在内50bp还是不包括同源臂只是插入片段就至少要50bp?...

Vazyme的one step cloning kit,可以插入50bp-10kb的片段,价格是in-fusion的五分之一。效果没话说,国产第一品牌
8楼2015-09-25 14:22:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

高gaoeryang

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
kangaroo0513: 金币+4, ★★★很有帮助 2015-09-25 20:24:59
引用回帖:
5楼: Originally posted by kangaroo0513 at 2015-09-25 12:46:06
你说的50bp指的是包括同源臂在内50bp还是不包括同源臂只是插入片段就至少要50bp?...

DNA片段,不含同源臂
9楼2015-09-25 15:42:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我等风起

铜虫 (初入文坛)

楼主,不知是否还有cre-loxp系统,可交换不?
10楼2017-02-15 16:15:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 kangaroo0513 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] FileCode能看出啥? +7 要乐观耀哥 2026-08-10 15/750 2026-08-10 19:29 by 要乐观耀哥
[基金申请] filecode +8 documentary 2026-08-10 8/400 2026-08-10 19:20 by loufangrui
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +14 Lanmanbaby 2026-08-09 22/1100 2026-08-10 14:57 by wwncly
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +11 archvillain 2026-08-04 13/650 2026-08-10 14:41 by seekfind
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
信息提示
请填处理意见