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Pipig

金虫 (小有名气)

[求助] 【TAIL-PCR】对于其测序结果的分析问题 已有2人参与

请问有做过TAIL-PCR 的朋友吗?
在把扩增得到的序列送测序后,改如何分析呢。请说一下详细步骤。

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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用测序结果和你原来的已知序列拼接,有重叠区能拼接上,说明扩出的序列是目标序列,如果没有重叠区拼接不上,说明扩出的是非目标片段。
3楼2015-09-17 12:40:47
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kobe199613

木虫之王 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
TAIL-PCR(thermal asymmetric interlaced PCR),即交错式热不对称PCR,是一种染色体步移技术(Genome Walking)。该技术通过3个嵌套的特异性引物分别和简并引物组合进行连续的PCR循环,利用不同的退火温度选择性地扩增目标片段,所获得的片段可以直接用做探针标记和测序模板。

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【招聘】医用高分子材料研发工程师(北京)
2楼2015-09-17 01:41:47
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Pipig

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2015-09-17 12:40:47
用测序结果和你原来的已知序列拼接,有重叠区能拼接上,说明扩出的序列是目标序列,如果没有重叠区拼接不上,说明扩出的是非目标片段。

你说的目标序列,就是说侧翼未知的序列吗?
有重叠的部分是不是就是边界序列那左右的序列?

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4楼2015-09-20 22:42:12
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by Pipig at 2015-09-20 22:42:12
你说的目标序列,就是说侧翼未知的序列吗?
有重叠的部分是不是就是边界序列那左右的序列?
...

5楼2015-09-20 23:40:00
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