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changmaster

新虫 (小有名气)

[求助] qpcr相关问题

在公司高通量测序后,回来的测序结果,得到一些unigene的FASTA格式的碱基序列,不知道这样的unigene能不能直接拿来设计引物,做后续的qpcr。
例如:>c16649_g1
GGCGTGGCCTGTCGCGCATGTGTGGCGCAGGCGCGGCCAGCGGCATTGCCTCTGGCGGGGGCGTGGCCGCTCTGCCGCCG
CATCCGGACCCGTGCCTCGGCCGTGAGGCCAAATCCCCGCGCGCGTCGCCCACCTCGTGCGCCCCCCCACGCCGACGCCA
TCGCCTCGTGCAGTCGTCGACGTCGTCCGGGACACCCGCGTCGGCACCACCACCCTCCCCCCACACCCCCGCCCTATCAC
TGCGCGCTTCTCTCCACTTTCCCCCGCGGTCCCACACCGGCTGCGTCTCGCCCGTGTTCCTGCCACGACCTCTCGCGTCG
CATCCACTGTGCCCCCCCCCCTCCCTCCCACCATGGCGGCCTTTGTCGCGGGCGCGGTGTCTGTGCCGACGGGGGGCTCC
CTGCGGGCGGGCGCGCTGAGCGGCCGCCCGTTGACCGTCTCGACGGTGGCGCCCGCGCCGGCGGGTCGTCCGGCCGTGTC
GGGCATCTCGATGAAGGGGCAGACTATCGGCTACGGAAAGTGGAAGGGCGGCTTCCCCGGCGGGGAGGCCTTCTTCAAGC
AGTGGCTCGCCGAGGGCATGACGGGTGACGTGCCCGACATGCCCGACGAGCTGCAGTCGCGCACCGAGTATGAGGCGCCC
GAGCCCAAGGTGGACCCCCGCGAGTGGTACGCGGACATGGTGCCCGTGCCCAAGGGACTGAAGAGCAAGCCCAAGCTGTC
GGAGACGCTGTCGGCCGCCGGCTCGGCGGTCGAGTCTGCCGTGGACGATGTGGCTTCGGCGGCGAGTGAGAGCGGCTCGG
TGGTTGCTGCCGTCGCCAGCGACGGTGTGAGCGGTGTGAAGAAGGCGGCCAAGAAGGTGGCCAAGAAGGTAGGTGCCGCC
TCTGCGGATGGCGACGCGGGCCCCGACCCCGCGCTGTATGACAAGTACTACCCCGCGGACAAGCGGAATCTTGCGCCCCA
CATCAACCTGTCCGACGCCGACCAGCAGGTGTCGATGAACATGGCGCCCGTTGAGTCTGGCTTTTACGAGCGGTTCTACC
CCAAGGAGACGCTGAACAAGGCGCCAATCATTGACATTTTCTACTCGGGTGCCCTCTCCACCGCGAGCGTGTCGCTCAAG
ATGGCAGAGGTGGAGGGCCTCCCCACGCCGGCGATCGTACCCAAGGGCGAAGTCCAAACAAGCCTGGTGCCGTCTGCGGG
TGGCGGGCTCAAGCTGGACTTCAGCATCAGCGGCGGGGAGACGCTCAGCGCCTACTCGGACCCGCGGAGTGTCGACAAGT
ACGAGTCCATGCTGAAGGGTGCCGCCGCGGCGGCGCCGGCGGCGCCCAAGGCGGCGGCGACCGTCAAGGCGGGGGCCAAG
AAGGTGGCTGCCAAGGCGGCAGCGCCGGTCAAGAAGGGTGGCTTCAAGCTGCCCAACCCCTTTGCCAAGAAGTAGGCACG
CCCCGGGTGGGTGTGAGCACCGCGTCGTGAGCTGCTGTGTGGTTTGCCTGTATGGAGCATTATTTTTTTCTTCGTCTACA
ATTCCCCGTCCCACGTTGTCTCCGAGTGGCCCTCGAGTGGCTGTCGAGCGCGCCATGGCGCTGGCTATCTGCCGCTGGAC
TGCTCCCGCTGTTGGTGGCTGTGCCATGTAGTAGGAGATCCGCTGGTGTATGCGCGGCAAGCACGAATCGCGTTGGTGTT
GAGGCTGGTCGAGCGGAACGGGAGTGATCGCGTCGGTTTTGAGAGCTGGTCGAGAACGGCACCTTTTGCTTCATGAGTAG
TGACTTTGTTGTGCAATCTTGGGCTGCCGTGGCGTATTACTCCACGGCCCTCTGACTTTGTCTGGATGACGCCCGCCCGG
TGACGGCCTCCTTTCTCTACCGCAACACTGCTGGCCGCCGCGGCCTCTCTGCTTCTACGGCGTCGCGCTGGGACCCGTGC
CCAGCCGTGAATCCCCACACGGCGCCCGCCGCTCCACCTCCCCCCCCATATGCACCACTCGCGTCTGGGGACCACGCGCG
CATCCACCACCGCCGCCGCCGCCGAGCGTCCCGGCCTGGTCCGCCGACGCGCACGCCGCCACGGCCACCGCCGCCGCCGC
CGCCG
求大神不吝赐教,谢谢了
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做自己,不试图成为任何人
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cf沐晴

新虫 (正式写手)

2楼2017-06-21 18:02:41
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土豆-小飞虫

新虫 (小有名气)

荧光定量不用扩这么长的片段

发自小木虫IOS客户端
3楼2017-06-23 09:13:18
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