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huxing5066

金虫 (小有名气)

[求助] NCBI上blast一段基因序列时的问题~求大神解答呢~ 已有1人参与

问题如下:在NCBI上blast一段大肠杆菌基因序列时(我期望得到基他非大肠杆菌上的类似功能的基因片段),但是显示的前100位都是大肠杆菌的片段,如何显示100位以后其他不同菌株的基因呀?不知道这个问题我描述清楚了吗?希望大神能给我实际的指导~



PS:我是务实派,解答越详细,相应金币将给越多,不相关的回答将不给金币~
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huxing5066

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by liuderong at 2015-09-16 11:40:23
blast页面有设置显示结果数目的选项,进入NCBI的blast界面(就是那个可以粘贴序列的界面),把网页拉到最下面,注意看网站的左下方,有一个“+Algorithm parameters ”(在那个的“blast”点击按钮的下面),点击那 ...

我还可以再问你一下这个blast之后,出现的页面上第一行Descriptions/max score/Total score/Query cover / E value /Iednt/Accession分别是什么意思呀?尤其是评分分别代表什么,百分之多少以内,算同一类或同一种蛋白呀?
5楼2015-09-21 20:45:43
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baichi121234

禁虫 (职业作家)

本帖内容被屏蔽

2楼2015-09-14 00:31:07
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
huxing5066: 金币+50, ★★★★★最佳答案, 40 2015-09-19 10:06:43
blast页面有设置显示结果数目的选项,进入NCBI的blast界面(就是那个可以粘贴序列的界面),把网页拉到最下面,注意看网站的左下方,有一个“+Algorithm parameters ”(在那个的“blast”点击按钮的下面),点击那个“+”号就可以进入设置菜单,设置“Max target sequences”就可以显示更多的比对结果。
其实你这种任务应该用本地blast,那个复杂一点,可以自己到网上找资料看看。
3楼2015-09-16 11:40:23
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huxing5066

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by liuderong at 2015-09-16 11:40:23
blast页面有设置显示结果数目的选项,进入NCBI的blast界面(就是那个可以粘贴序列的界面),把网页拉到最下面,注意看网站的左下方,有一个“+Algorithm parameters ”(在那个的“blast”点击按钮的下面),点击那 ...

给你四十金币,留十个给楼上的,可以不?版主帮我送一下,谢谢哦~
4楼2015-09-19 10:07:13
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