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shxteacher

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 关于NTA-Ni纯化带有Flag标签的融合蛋白

本人今天实验发现一个奇怪的现象:
我讲带有Flag标签的融合蛋白的细胞裂解液过NTA-Ni的重力柱,然后用1xBinding buffer洗柱子(15倍柱体积),然后直接用1xStrip buffer(主要成分是EDTA溶液),并且收集1xStrip buffer的洗脱液(1倍柱体积),然后跑SDS-PAGE,发现存在一个比较纯的而且是带有Flag标签的目的蛋白。
说明:目的蛋白仅带有Flag标签,不带有His标签。

我很疑惑:难道Flag标签的融合蛋白也可以吸附在NTA-Ni重力柱?
Flag tag的蛋白序列:DYKDDDDK
His tag的蛋白质序列:HHHHHH

我在怀疑是不是Flag标签中含有较多的天冬氨酸,也可以螯合Ni?
不知道有木有科研同仁遇到这样的情况?
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OMG
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穿白大褂约会

禁言 (小有名气)

★ ★
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-09-14 23:07:12
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5楼2015-09-14 22:32:11
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lxzk

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-09-14 23:06:27
你的蛋白本身有没有类似序列?Ni柱的特异性不是很强,经常会从裂解液中拉下一些条带。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2015-09-13 09:51:39
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naringenin

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
flag里面的天冬氨酸是带正电的,我想如果ni柱恢复的不好的话,有些空位点连上了flag标签,而后strip buffer洗下来了吧?
话说为啥不用咪唑洗蛋白呢
3楼2015-09-13 15:49:27
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hc-material

专家顾问 (职业作家)

★ ★ ★ ★
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西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2015-09-14 23:06:49
存在很多疑点:
1.上样量多少,是否过量。
2.你依据什么判断的不带HIS标签????你用还有EDTA的溶液洗脱,镍离子被EDTA结合,从柱子上洗脱下,同时,HIS标签也会被洗脱下来。
3.要判断,你先用咪唑试试,用EDTA 洗脱,说不含有HIS标签有点草率,你用EDTA洗镍柱,你的镍柱那能用么??你要再生重新挂捏么。
4楼2015-09-14 09:35:45
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