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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » fix ave/spatial疑问
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809011916

铜虫 (小有名气)

[求助] fix ave/spatial疑问 已有1人参与

大致看了manual中关于fix ave/spatial命令的解说，并将其应用到NEMD中，发现在fix速度梯度（eg: fix 3 all ave/spatial 500 1 500 z lower 10 vz norm sample file vel.profile ）的时候一切都很正常，但是在fix density/mass的时候出现了如下的错误：Fix ave/spatial settings invalid with changing box size。因为要做NEMD ，所以前面还fix了nvt/sllod和deform，最后才进行fix ave/spatial density/mass。错误显示的是命令因为盒长在变所以无效，那请各位大侠分析下无效的原因？看了文献，附件图中mass density的输出形式应该是由此条命令进行输出的吧？那么我该如何更改自己的in文件呢？

请各位lammps大侠拔刀相助，走过路过给个解决问题的建议，先行谢过了！

fix ave/spatial疑问
疑问1.jpg
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1楼 2015-09-11 13:53:00
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hongruding

铁虫 (初入文坛)
你好 我想请问一下，fix density/mass 输出的单位是什么，我使用的units是real 但是输出的density/mass 文件里的值一般都在几十，实际密度不可能会有几十g/cm^3的。麻烦给个建议，谢谢！
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GetwhatUPay
2楼2016-01-03 17:02:28
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黑皮糖22

新虫 (初入文坛)
你好，我现在也出现在统计切片密度的时候盒长在变，请问你知道为什么了吗？谢谢～～

发自小木虫IOS客户端
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3楼2016-03-15 02:05:19
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alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by hongruding at 2016-01-03 03:02:28
你好 我想请问一下，fix density/mass 输出的单位是什么，我使用的units是real 但是输出的density/mass 文件里的值一般都在几十，实际密度不可能会有几十g/cm^3的。麻烦给个建议，谢谢！

是最后一列的值吗？几十太高了。
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4楼2016-03-15 02:28:03
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alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

楼主可以贴出density/mass的fix命令吗？
当box size改变的时候，fix ave/spatial 是不支持 ave running 和 ave window的。不知都楼主用否？
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5楼2016-03-15 02:37:01
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