应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 做细菌的荧光定量PCR，SYBR GREEN I 染料，提取的是DNA，选择什么内参比较好？
171/2返回列表12下一页
查看: 3597  |  回复: 16
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

runye2015

新虫 (小有名气)

[交流] 做细菌的荧光定量PCR，SYBR GREEN I 染料，提取的是DNA，选择什么内参比较好？

如题，GAPDH，β-actin 还是18s rRNA？这些内参可以买到吗？谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2015-09-08 17:14:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

runye2015

新虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 我不是小郭 at 2015-09-10 16:17:36
根据实验的实际情况，不同组织、不同细胞、细胞的不同生理时期、不同的理化条件刺激等，查阅相关资料，选取三、四合适的内参基因，做荧光定量PCR，先以CT值最小的那条基因作为内参，其他几条内参基因与其相比，分析 ...

嗯～学习了！！非常谢谢！！

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下(1人) 回复此楼
13楼2015-09-11 23:25:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

xiaochong8693

木虫之王 (文坛精英)
祝福楼主啊！
回复此楼
2楼2015-09-08 17:40:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

runye2015

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaochong8693 at 2015-09-08 17:40:58
祝福楼主啊！

嗯～谢谢！

[ 发自小木虫客户端 ]
回复此楼
3楼2015-09-08 18:49:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

王平阳

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
runye2015: 金币+3 2015-09-08 22:06:36
用DNA做定量？这个。。。什么目的啊？如果是基因组DNA作为模板定量，那么你说的几种都不能用，那是cDNA做模板定量的内参，没听说过用基因组DNA为模板的定量，建议你还是想想你这样做的目的是什么。
不好意思没帮到你
赞一下 回复此楼
没有做不到，只有想不到！
4楼2015-09-08 20:40:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

runye2015

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 王平阳 at 2015-09-08 20:40:27
用DNA做定量？这个。。。什么目的啊？如果是基因组DNA作为模板定量，那么你说的几种都不能用，那是cDNA做模板定量的内参，没听说过用基因组DNA为模板的定量，建议你还是想想你这样做的目的是什么。
不好意思没帮到 ...

我的实验是对几种细菌进行定量，提取的是总的DNA,然后这几种细菌的设计引物，再进行荧光定量，半定量，之前在网上查的是绝对定量通过标准曲线进行精确定量～半定量通过内参，现在不知道内参用什么～～谢谢您的回复！

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
5楼2015-09-08 22:04:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hutingting

银虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
runye2015: 金币+6 2015-09-10 12:50:35
我做过，测各个菌株的RNA水平，逆转录之后cDNA为模板，16S做内参的，引物序列文献里有，去合成一对就是了
赞一下 回复此楼
6楼2015-09-10 11:40:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

runye2015

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hutingting at 2015-09-10 11:40:37
我做过，测各个菌株的RNA水平，逆转录之后cDNA为模板，16S做内参的，引物序列文献里有，去合成一对就是了

非常感谢您的回复！
我的实验是在总的DNA里检测三种细菌，已经设计了引物，这个引物可以用吗？～
意思是用cDNA和引物反应得到的目的片段为内参吗？～～这方面不是特别了解～谢谢！

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
7楼2015-09-10 12:54:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hutingting

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by runye2015 at 2015-09-10 12:54:53
非常感谢您的回复！
我的实验是在总的DNA里检测三种细菌，已经设计了引物，这个引物可以用吗？～
意思是用cDNA和引物反应得到的目的片段为内参吗？～～这方面不是特别了解～谢谢！
...

不太明白你的实验目的是什么？是鉴定细菌种类？还是检测三种细菌中哪一种中某个基因的表达量高低？我的实验是检测不同菌株中某一基因的mRNA水平的高低，所以提取总RNA，oligo dT引物逆转录成cDNA，以一株细菌检测为例，cDNA为模板，一管realtime pcr反应中加入目的基因扩增引物，对照则是另一管realtimepcr反应中加入16S引物，确定这两对扩增效率都在100%的前提下，通过CT值之比，得出各株之间相对mRNA水平
赞一下 回复此楼
8楼2015-09-10 13:59:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hutingting

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by runye2015 at 2015-09-10 12:54:53
非常感谢您的回复！
我的实验是在总的DNA里检测三种细菌，已经设计了引物，这个引物可以用吗？～
意思是用cDNA和引物反应得到的目的片段为内参吗？～～这方面不是特别了解～谢谢！
...

另外我们检测真核细胞某基因的DNA水平，是提取基因组DNA，以GAPDH为内参的，用的是绝对定量测拷贝数，细菌中有的基因在基因组是单拷贝的，具体情况具体对待吧，可以找几篇文献看看
赞一下 回复此楼
9楼2015-09-10 14:03:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我不是小郭

木虫 (小有名气)

此人有毒
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
根据实验的实际情况，不同组织、不同细胞、细胞的不同生理时期、不同的理化条件刺激等，查阅相关资料，选取三、四合适的内参基因，做荧光定量PCR，先以CT值最小的那条基因作为内参，其他几条内参基因与其相比，分析所得的比值，找出比值稳定的几条基因，比值稳定说明该基因表达稳定，适合作为理想的内参。
      也可用geNorm内参分析软件来选择合适的内参基因。
      对于比较精确的实验，最好采用两种或两种以上表达稳定的基因作内参，对每种内参基因测得的基因表达变化求方差和平均值。
赞一下 回复此楼
实践是检验真理的唯一标准
10楼2015-09-10 16:17:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 runye2015 的主题更新
171/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 澳大利亚 Murdoch University 全奖博士招生（3个名额）地质化工冶金领域 +80 AI8RaGaPaSCR 2026-08-07 84/4200 2026-08-14 10:45 by rkvMDKApspAV
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊 +10 Tide man 2026-08-10 11/550 2026-08-14 10:30 by 沁言学术
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +14 医学老男孩 2026-08-13 36/1800 2026-08-14 09:41 by 医学老男孩
[基金申请] FileCode能看出啥？ +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +4 启萌科技 2026-08-12 12/600 2026-08-14 09:07 by switchoff
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[硕博家园] 一作与独作在应聘高校教师时区别大吗 +3 mbygzh 2026-08-08 4/200 2026-08-13 19:31 by 龙-樱
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 36/1800 2026-08-12 22:50 by sdfapple719
[基金申请] 好奇怪的filecode +5 布布和一二 2026-08-08 6/300 2026-08-12 16:11 by 云上清扬
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？ +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果？ +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 确定了，国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 关于代码变化问题，想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变，有变的大神么？ +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭