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dyc_2008

捐助贵宾 (著名写手)

[求助] LAMMPS中如何构建溶质原子随机分布的固溶体 已有2人参与

LAMMPS中如何构建溶质原子随机分布的固溶体?
是有什么特殊的命令?
还是要借助什么特殊的软件?
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一布福田,二修菩提
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小卒无名

金虫 (小有名气)

这个很简单就可以实现。假设你的固溶体是A-B,结构是fcc结构。类似这样的代码就可以实现
lattice fcc ${lc}
region box block 0 ${xmax} 0 ${ymax} 0 ${zmax}
create_box 2 box
create_atoms 1 region box

set type 1 type/fraction 2 ${content} ${yourSeed}
这样就可以了
6楼2016-01-25 12:54:08
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查看全部 7 个回答

alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
energy minimize就可以了
2楼2015-08-23 02:27:33
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alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
dyc_2008: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-08-23 10:04:53
或者采用moltemplate工具
这个工具在tools/moltemplate下

moltemplate.sh system.lt
在system.lt里面用random命令

例子可以再网上找到,
比如
myMol = new random([mol1, mol2, mol3], [0.2, 0.3, 0.5], 102993) # 1.分子列表,2. 浓度列表,随机seed
                    [10].move(10, 0, 0).rot(180, 1, 0, 0) # 在x方向创10个,间距为10A,绕着x轴连续旋转180度
                    [2].move(0,2,0).rot(90, 0, 1, 0) # 在y方向上创2个,间距为2A, 绕着y轴旋转90度
                    [9].move(0,0.8).rot(29, 0, 0, 1) # 在z方向上创9个,间距为8A,绕着z轴旋转29度
3楼2015-08-23 06:00:16
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dyc_2008

捐助贵宾 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by alundilong at 2015-08-23 06:00:16
或者采用moltemplate工具
这个工具在tools/moltemplate下

moltemplate.sh system.lt
在system.lt里面用random命令

例子可以再网上找到,
比如
myMol = new random(, , 102993) # 1.分子列表,2. 浓度列表 ...

非常感谢,但是:
我指的是固溶体(也就是合金)。
原子是周期性分布的,我的目的是要随机替换其中一些原子,来实现固溶体。
一布福田,二修菩提
4楼2015-08-23 10:04:42
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