24小时热门版块排行榜    

查看: 2236  |  回复: 21

xzh410512206

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-08-19 09:56:44
1、既然已经对基态进行了结构优化,那基态结构是如何的? 你直接用此基态结构算垂直激发看看呢?
2、频率计算的作用在于确认得出的结构是局部最小点。如果你不做频率计算,光做势能面扫描,也不能确定稳定构象。如 ...

1.整体意思是什么? 我扫描后得到的稳定结构,再进行一个频率计算?频率计算就是在关键词一行加 freq吗?计算的结果又是怎么查看的?
11楼2015-08-19 10:45:13
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
11楼: Originally posted by xzh410512206 at 2015-08-19 10:45:13
1.整体意思是什么? 我扫描后得到的稳定结构,再进行一个频率计算?频率计算就是在关键词一行加 freq吗?计算的结果又是怎么查看的?...

整体意思是说:在结构优化做好之后,怎么确定所得到的结构是稳定结构呢?这时候需要用频率去确定。对于基态,应该所有频率都为正。如果出现了一个或以上的虚频,说明这个结构不是基态,需要调整后再进行优化。
关键词就是opt之后再加freq。计算结果你可以用GV打开后在result里面有。
12楼2015-08-19 11:49:15
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xzh410512206

银虫 (小有名气)

引用回帖:
12楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-08-19 11:49:15
整体意思是说:在结构优化做好之后,怎么确定所得到的结构是稳定结构呢?这时候需要用频率去确定。对于基态,应该所有频率都为正。如果出现了一个或以上的虚频,说明这个结构不是基态,需要调整后再进行优化。
关 ...

哦哦。那我就把势能曲线上的稳定点(45°,135°,225°和315°)结构拿出来,进行opt+freq   然后看结果,确定这几个点是不是稳定构象?
13楼2015-08-19 14:13:02
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
13楼: Originally posted by xzh410512206 at 2015-08-19 14:13:02
哦哦。那我就把势能曲线上的稳定点(45°,135°,225°和315°)结构拿出来,进行opt+freq   然后看结果,确定这几个点是不是稳定构象?...

可以这么尝试
14楼2015-08-19 14:51:52
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xzh410512206

银虫 (小有名气)

引用回帖:
14楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-08-19 14:51:52
可以这么尝试...

不好意思  再打扰一下。。计算完  查看频率是否全是正值的关键词是什么?直接搜freq吗?
15楼2015-08-19 16:32:44
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xzh410512206

银虫 (小有名气)

引用回帖:
14楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-08-19 14:51:52
可以这么尝试...

我扫描得到的势能曲线上的极小值点45°、135°、225°和315°   频率都没有负值,而且90°这样的不稳定点也没有负值。。所以是能确定这4个角度对应的4个结构就是基态稳定构象了吗?!
16楼2015-08-19 20:37:19
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

virtualzx

木虫 (著名写手)

实验测定的具体是什么量?描述一下你的实验。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
17楼2015-08-20 03:04:43
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
16楼: Originally posted by xzh410512206 at 2015-08-19 20:37:19
我扫描得到的势能曲线上的极小值点45°、135°、225°和315°   频率都没有负值,而且90°这样的不稳定点也没有负值。。所以是能确定这4个角度对应的4个结构就是基态稳定构象了吗?!...

把你90°的输出文件发上来看看吧,有点兴趣啊
18楼2015-08-20 08:39:30
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xzh410512206

银虫 (小有名气)

引用回帖:
18楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-08-20 08:39:30
把你90°的输出文件发上来看看吧,有点兴趣啊...

好的   我上传了log文件,应该能下载吧

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 90.log
  • 2015-08-20 10:46:40, 1.93 M
19楼2015-08-20 10:46:42
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xzh410512206

银虫 (小有名气)

引用回帖:
17楼: Originally posted by virtualzx at 2015-08-20 03:04:43
实验测定的具体是什么量?描述一下你的实验。

实验部分不是我做的  是我们小老板负责的    我问问他哈
20楼2015-08-20 10:47:57
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xzh410512206 的主题更新
信息提示
请填处理意见