24小时热门版块排行榜    

查看: 1876  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

speedking

木虫 (正式写手)

[求助] 向NCBI提交序列出问题,请各位分子生物的大神帮忙看看!! 已有1人参与

小弟第一次提交核酸序列,菜鸟一个,上周向NCBI提交我做实验得到的序列,提交后NCBI发来邮件说我提交的序列有很多错误,请大神帮忙看看什么意思,需要怎么修改,下面是邮件的部分截图,其中第3和第4张图是我保存的sqn文件用sequin软件打开后出现的错误截图。我需要怎么修改,麻烦说的具体点,小弟在此先拜谢了!!

向NCBI提交序列出问题,请各位分子生物的大神帮忙看看!!
1.png


向NCBI提交序列出问题,请各位分子生物的大神帮忙看看!!-1
2.png


向NCBI提交序列出问题,请各位分子生物的大神帮忙看看!!-2
3.png


向NCBI提交序列出问题,请各位分子生物的大神帮忙看看!!-3
4.png
回复此楼
人生总会累的,现在不累,以后会更累!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xuyuhuaxue

新虫 (初入文坛)

双击问题序列的CDS,在弹出框中点击location选项,如果是部分基因序列,把5'和3‘勾上,同时修改翻译的启示位置和翻译的正反链,修改完后点击codingregion 选项,点击translate product 看有无终止密码子,有的话返回location选项,继续修改,直至没有问题。再到Search选项中点击validate检查是否正确,直到正确为止。
4楼2016-03-10 10:47:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

ls2046

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
speedking: 金币+100, 有帮助 2015-08-09 12:44:54
意思是,你提交的16S DNA有误,你提供 的CDS(coding sequence)序列里非正常的终止密码子。你要搞清楚的序列的特征,如果你的是16S DNA,就按照网站的提示选择这项,如果选择了其它项,就有可能出错。CDS是编码需要,是要翻译成蛋白质的,跟16S DNA是有区别的。仔细按照网站的提示慢慢搞,其实很容易的。人家的使用说明都很详细。
一品黄山
2楼2015-08-07 14:03:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

speedking

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ls2046 at 2015-08-07 14:03:31
意思是,你提交的16S DNA有误,你提供 的CDS(coding sequence)序列里非正常的终止密码子。你要搞清楚的序列的特征,如果你的是16S DNA,就按照网站的提示选择这项,如果选择了其它项,就有可能出错。CDS是编码需要 ...

需要将我的sqn文件用sequin软件打开,在那个上面一个一个的修改吗?
人生总会累的,现在不累,以后会更累!
3楼2015-08-07 14:15:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 什么时候开奖? +9 CrisMessi 2026-08-18 10/500 2026-08-23 12:03 by 丶昵称占用
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +15 羊腰板 2026-08-21 16/800 2026-08-23 10:45 by process2012
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 10/500 2026-08-23 07:17 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 04:04 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:43 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:04 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 11/550 2026-08-23 02:55 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[教师之家] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 4/200 2026-08-22 16:52 by sunzitan
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +10 kulium 2026-08-21 13/650 2026-08-21 21:58 by alongwaytogo
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
请填处理意见