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speedking

木虫 (正式写手)

[求助] 向NCBI提交序列出问题，请各位分子生物的大神帮忙看看！！ 已有1人参与

小弟第一次提交核酸序列，菜鸟一个，上周向NCBI提交我做实验得到的序列，提交后NCBI发来邮件说我提交的序列有很多错误，请大神帮忙看看什么意思，需要怎么修改，下面是邮件的部分截图，其中第3和第4张图是我保存的sqn文件用sequin软件打开后出现的错误截图。我需要怎么修改，麻烦说的具体点，小弟在此先拜谢了！！

向NCBI提交序列出问题，请各位分子生物的大神帮忙看看！！
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向NCBI提交序列出问题，请各位分子生物的大神帮忙看看！！-1
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人生总会累的，现在不累，以后会更累！
1楼 2015-08-07 13:34:51
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speedking

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by ls2046 at 2015-08-07 14:03:31
意思是，你提交的16S DNA有误，你提供 的CDS（coding sequence)序列里非正常的终止密码子。你要搞清楚的序列的特征，如果你的是16S DNA，就按照网站的提示选择这项，如果选择了其它项，就有可能出错。CDS是编码需要 ...

需要将我的sqn文件用sequin软件打开，在那个上面一个一个的修改吗？
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人生总会累的，现在不累，以后会更累！
3楼2015-08-07 14:15:27
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ls2046

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
speedking: 金币+100, ★有帮助 2015-08-09 12:44:54
意思是，你提交的16S DNA有误，你提供 的CDS（coding sequence)序列里非正常的终止密码子。你要搞清楚的序列的特征，如果你的是16S DNA，就按照网站的提示选择这项，如果选择了其它项，就有可能出错。CDS是编码需要，是要翻译成蛋白质的，跟16S DNA是有区别的。仔细按照网站的提示慢慢搞，其实很容易的。人家的使用说明都很详细。
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一品黄山
2楼2015-08-07 14:03:31
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xuyuhuaxue

新虫 (初入文坛)
双击问题序列的CDS,在弹出框中点击location选项，如果是部分基因序列，把5'和3‘勾上，同时修改翻译的启示位置和翻译的正反链，修改完后点击codingregion 选项，点击translate product 看有无终止密码子，有的话返回location选项，继续修改，直至没有问题。再到Search选项中点击validate检查是否正确，直到正确为止。
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4楼2016-03-10 10:47:59
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