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xiaokuan4185

铁虫 (初入文坛)

[交流] 求助RNA的提取方法

求助RNA的提取方法
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bluesky
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★ ★
reasonspare(金币+3,VIP+0):thx
总RNA提取

材料
1.        Trizol
2.        氯仿
3.        异丙醇
4.        无水乙醇
5.        冷冻(0–4℃) 75%乙醇
6.        DEPC水
方法
1.        按100mg组织/1ml Trizol的量匀浆组织块(或107个细胞/1ml Trizol)。吹打团块裂解细胞,后vortex 30s。贴壁细胞直接在皿中裂解,按1ml Trizol/10 cm2加入Trizol后吹打裂解细胞。转移到小管中vortex 30s
2.        12,000g 4℃离心10min。取上清,室温静置10min。
3.        按每1ml Trizol加0.2ml氯仿的量加入氯仿,剧烈手摇混匀,后室温静置3min。
4.        12,000g 4℃离心15min。取水相到新管。
5.        按每1ml Trizol加0.5ml异丙醇的量加异丙醇,稍vortex,室温静置10min沉淀RNA。12,000g 4℃离心10min。
6.        弃上清,加0.5ml 75%冷冻乙醇洗涤。12,000g 4℃离心5min,移弃乙醇。稍离心富集管壁乙醇,移弃。在空气中干燥3–5 min,用DEPC水重悬RNA。
7.        测OD260/OD280。1.8-2.0时,认为RNA中蛋白或者其他有机物的污染是可以容忍的。当R<1.8时,溶液中蛋白或者其他有机物的污染比较明显。当R>2.2时,说明RNA已经水解成单核酸了。
8.        琼脂糖检验。如果28S和18S条带明亮、清晰、条带锐利,并且28S的亮度在18S条带的两倍以上,我们认为RNA的质量是好。





其中有些离心步骤可以省略,如果是用细胞来提取的话~~~
这个针对的是动物组织和细胞的
2楼2008-08-14 21:18:48
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菜鸟飞吧

★ ★
reasonspare(金币+2,VIP+0): 鼓励一下
呵呵,楼上的已经比较详尽了,操作时注意防止RNase污染,tip和tube用RNase-free的或者用DEPC泡过的
3楼2008-08-17 12:41:52
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


reasonspare(金币+1,VIP+0):thx
我们用Axygen的进口管子和枪头
4楼2008-08-17 14:28:29
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feiyu21214

新虫 (初入文坛)

我的实验步骤跟上面差不多吧
可是我提取出来的RNA量目测还不少
但是反转录第一条CDNA后跑胶
发现带很暗了
怎么回事呢?
请教!!!!!!!
5楼2008-08-23 18:00:01
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

单链DNA跑琼脂糖是几乎看不见的……
6楼2008-08-23 19:45:15
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hejp03

至尊木虫 (著名写手)


xyklmu(金币+1,VIP+0):感谢答复
用酚氯仿效果会更好一些,最后小分子污染会较小,也就是A260/230更大一些
7楼2008-08-24 17:05:55
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lujing078883

提取RNA

★ ★
xyklmu(金币+2,VIP+0):感谢答复
1、将组织在液氮中磨成粉末后,再以50-100mg组织加入1ml Trizol液研磨,注意样品总体积不能超过所用Trizol体积的10%。将研磨液抽提到tube管中。匀浆30秒。
2、        加入200微升氯仿,匀浆30秒。12000转离心5分钟。
3、        将上清液移至新tube管中,加入等体积异丙醇,室温放置5分钟后,12000转离心5分钟。
4、        去除上清液,加入浓度为70%的酒精700微升,12000转离心2分钟。
5、        同上
6、        去除酒精,干燥3至5分钟。
7、        加入40微升DEPC灭菌封口后放入液氮罐保存。
8楼2008-08-25 09:07:31
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thesea3983

铁虫 (小有名气)

我觉得用Trizol和异硫氰酸胍并用效果更好!
第一步加和Trizol等量的异硫氰酸胍,其他步骤按Trizol的方法提就可以!
9楼2008-09-08 13:21:44
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naturewind1

木虫 (著名写手)

请问做RT如果是组织,怎么取材、保存?是无菌取材吗?样品本身不是无菌怎么办?取材后存于液氮吗?冻存管要怎样处理?急,谢谢!!!!!!!!!!!!
10楼2008-09-26 09:40:34
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