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菜鸟提问,如何选取建树序列?谢谢!
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yf-deng
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虫号: 447746
注册: 2007-11-01
性别: GG
专业: 动物遗传学
不好意思,出差多天,没有能及时看到各位的回复!多谢各位的详细解答!
我现在做的是一个很保守的功能基因,主要目的不在于物种分类。只是想把这部分内容加进去。我用mega4.1建nj进化树的时候置信度有好几个都低于50%(都是一个大类群的物种,用的是氨基酸序列),最后只好忍痛割爱舍去了好几个才是各个置信度都在50%以上。最终的进化树和传统分类地位一致。
确实gene cluster的分析现在做得比较多,不过说实话我很难做到全局上去选取序列。是该学学如何用Phylips了!多谢xyklmu老师!
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11楼
2008-08-22 10:59:34
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