应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 看轨道
131/2返回列表12下一页
查看: 1420  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

陈攀211

铜虫 (初入文坛)

[求助] 看轨道 已有3人参与

请问大家，关于一个自旋多重度为4的络合物，如何从计算完了的CHK文件里看分子的HOMO/LUMO？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
让天赋自由，以为爱珍惜！
1楼 2015-07-13 20:53:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

oinkmasta

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2, 谢谢交流 2015-07-14 16:31:41
GaussView打开output－－在output窗口右键－－选择edit－－选择MO
里面有分子轨道，往上翻到第一个没电子的就是LUMO，最后一个有电子的是HOMO。要看单个轨道电子云密度图的话，再做一个fchk文件。
赞一下 回复此楼
16届本科在北美
2楼2015-07-13 21:11:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

陈攀211

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by oinkmasta at 2015-07-13 21:11:37
GaussView打开output－－在output窗口右键－－选择edit－－选择MO
里面有分子轨道，往上翻到第一个没电子的就是LUMO，最后一个有电子的是HOMO。要看单个轨道电子云密度图的话，再做一个fchk文件。

谢谢你的回复，请问你做金属有机化合物的高斯计算吗，对于一个带阳离子的金属有机配合物在计算时，对于方法，基组，电荷，自旋多重度的选择上，要注意什么以做能量优化。我计算完成一个结构，但是从输出文件来看，有些原本成键的两原子间距离拉得好长，是怎么回事？
赞一下 回复此楼
让天赋自由，以为爱珍惜！
3楼2015-07-14 09:28:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

陈攀211

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by oinkmasta at 2015-07-13 21:11:37
GaussView打开output－－在output窗口右键－－选择edit－－选择MO
里面有分子轨道，往上翻到第一个没电子的就是LUMO，最后一个有电子的是HOMO。要看单个轨道电子云密度图的话，再做一个fchk文件。

但是，有显示两列数据，一列是Alpha MOs ,另一列是Beta MOs , 参考那个呢
赞一下 回复此楼
让天赋自由，以为爱珍惜！
4楼2015-07-14 09:38:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qchem

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
单电子体系就不存在HOMO LUMO了

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
5楼2015-07-14 12:45:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZJboy

木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by qchem at 2015-07-14 12:45:37
单电子体系就不存在HOMO LUMO了

一般谈论SOMO
回复此楼
6楼2015-07-15 02:23:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZJboy

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
4楼: Originally posted by 陈攀211 at 2015-07-14 09:38:09
但是，有显示两列数据，一列是Alpha MOs ,另一列是Beta MOs , 参考那个呢...

一般考虑alpha。但是你想讨论什么问题？
赞一下 回复此楼
7楼2015-07-15 02:25:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZJboy

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by oinkmasta at 2015-07-13 21:11:37
GaussView打开output－－在output窗口右键－－选择edit－－选择MO
里面有分子轨道，往上翻到第一个没电子的就是LUMO，最后一个有电子的是HOMO。要看单个轨道电子云密度图的话，再做一个fchk文件。

如果不能用GV调用fchk来生成轨道图，就在服务器上用以下指令生成cube文件。
cubegen 0 MO=n a.fchk HOMO.cube 0 h&
赞一下 回复此楼
8楼2015-07-15 02:26:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZJboy

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 陈攀211 at 2015-07-14 09:28:08
谢谢你的回复，请问你做金属有机化合物的高斯计算吗，对于一个带阳离子的金属有机配合物在计算时，对于方法，基组，电荷，自旋多重度的选择上，要注意什么以做能量优化。我计算完成一个结构，但是从输出文件来看， ...

优化后距离变长是正常的。不过如果用M06泛函，以及对金属与配体加极化函数，距离应该不会变长很多。
另外，不要迷信原子间连线。只要距离超过默认值，就会取消原子间的连线，但这并不代表不成键。
赞一下 回复此楼
9楼2015-07-15 02:28:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

陈攀211

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by ZJboy at 2015-07-15 02:25:01
一般考虑alpha。但是你想讨论什么问题？...

我只是想知道多重度为4的体系，看HOMO/LUMO的值，以及它的轨道能量分布
赞一下 回复此楼
让天赋自由，以为爱珍惜！
10楼2015-07-15 08:45:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 陈攀211 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭