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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » LAMMPS并行版安装
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胜利笑哈哈

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10楼: Originally posted by alundilong at 2015-08-26 09:24:35
export PATH=Y_O_U_R_P_A_T_H:$PATH...

谢谢您的回复，我想问一下是在 .bashrc下设置吗，我现在搞不清楚这些东西
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11楼2015-08-26 12:44:05
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匿名

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12楼2015-08-26 19:40:03
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胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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12楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2015-08-26 19:40:03
单核运算：可在bash_profile或.bashrc中设置lammps可执行程序的环境变量，即export PATH=Y_O_U_R_P_A_T_H:$PATH，设置完成后可在本机任何文件夹下直接运行lmp_mpi < in.file

多核运算：需要给定lmp_mpi的路径 ...

楼主，非常感谢，根据你的提示，将Lammps的可执行文件的路径设置在bashrc中，但仍然是报错，类似于这么个错误，   "lmp_mpi: error while loading shared libraries: libnpl.so.12: cannot open shared object file: No such file or directory",    后来仍然在bashrc中添加了
export  PATH=/home/vm/mpich3/bin:/home/vm/fftw3/bin:/home/vm/jpeg/bin:$PATH 
export LD_LIBRARY_PATH=/home/vm/mpich3/lib:/home/vm/fftw3/lib:/home/vm/jpeg/lib:$LD_LIBRARY_PATH
这个路径，单核运算就成功了；然后我尝试了多核运算，您说的需要加上路径在我的电脑上报错，然后我试着不加路径 如此输入 mpirun -np 4 ./lmpi_mpi<in.crack   ，就能成功运行。我之前这样运行过，不成功，可能后来加上的三个路径的原因吧。
再次十分感谢楼主，和各位朋友对我提问的回复，谢谢!
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13楼2015-08-26 22:42:05
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匿名

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14楼2015-08-27 17:37:42
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胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)
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14楼: Originally posted by liuzhu0706 at 2015-08-27 17:37:42
祝贺祝贺...

我之前也是这样，后来，在bashrc中加入了这个路径，就好了
export  PATH=/home/vm/mpich3/bin:/home/vm/fftw3/bin:/home/vm/jpeg/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/vm/mpich3/lib:/home/vm/fftw3/lib:/home/vm/jpeg/lib:$LD_LIBRARY_PATH
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15楼2015-08-31 12:12:04
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scutxl

新虫 (初入文坛)
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楼主！感谢你分享的方法。找你的方法做了，但是在make mpi这一步的时候。
会报错，主要是fftw3的lib文件的问题，好像FFT—LIB=  -fftw3不行，然后我看了
lib文件夹，只有fftw3f，换上去还是不行，显示的是fftw3d的一些报错。不知道是什么原因？
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16楼2015-09-28 10:56:18
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childsliu

捐助贵宾 (正式写手)

二当家的
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16楼: Originally posted by scutxl at 2015-09-28 10:56:18
楼主！感谢你分享的方法。找你的方法做了，但是在make mpi这一步的时候。
会报错，主要是fftw3的lib文件的问题，好像FFT—LIB=  -fftw3不行，然后我看了
lib文件夹，只有fftw3f，换上去还是不行，显示的是fftw3d的 ...

遇到同样的问题，请问解决了么？
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下苦功，三个字，一个叫下，一个叫苦，一个叫功，一定要振作精神，下苦功。
17楼2015-10-23 09:39:48
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lyam

铁杆木虫 (正式写手)
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引用回帖:
17楼: Originally posted by childsliu at 2015-10-23 09:39:48
遇到同样的问题，请问解决了么？...

The same problem Did you solve it??
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18楼2015-12-22 14:43:58
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冬藤

新虫 (初入文坛)
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
版主你好，我用了你的方法为什么到最后无法生成lmp_mpi文件呢？最后输入make mpi的时候终端上显示的是“命令未找到”。
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19楼2015-12-23 05:33:47
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冬藤

新虫 (初入文坛)
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版主你好，我用了你的方法为什么到最后无法生成lmp_mpi文件呢？最后输入make mpi的时候终端上显示的是“命令未找到”。
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20楼2015-12-23 07:33:19
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