24小时热门版块排行榜    

查看: 1664  |  回复: 16
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

xtulidan

新虫 (小有名气)

[求助] 配合物结构优化已有3人参与

本人想用高斯09 opt-DFT优化一个配合物的结构,使用的是B3LYP以及6-31+基组,过程老断键,不知如何是好,有没有哪位能提供一些建议或则输入文件,感谢!

配合物结构优化
W@)OA$Q[QQ[6]H]IRE6TR7T.png


配合物结构优化-1
Z1TJ$V$TD[VC1TXG`4W50~8.png
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阿克飞顿

金虫 (正式写手)

引用回帖:
14楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-09-24 09:36:14
Au带+1,整个体系是电中性?...

嗯谢谢您。因为我之前没算过配合物的,所以我想再问您一句,这个+1怎么添加到输入文件里,写在哪个位置?

发自小木虫Android客户端
15楼2015-09-24 09:57:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

122ybb

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+1, 谢谢交流 2015-07-08 15:54:42
你的这个输入文件是个平面分子吗,如果是,你应该先将其稍加修改,使其原子不在同一平面上,然后再优化
明天比今天更好!
2楼2015-07-08 15:39:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xtulidan

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 122ybb at 2015-07-08 15:39:06
你的这个输入文件是个平面分子吗,如果是,你应该先将其稍加修改,使其原子不在同一平面上,然后再优化

不是,chem3D里显示的不是平面分子,MM2进行能量初步优化时,有些原子识别不了,但是可以进行高斯计算,但是,就是会出现断键的情况。
3楼2015-07-08 17:53:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用GV打开你用于计算的输入文件,看看初始结构是否合理。或者你贴出你的输入文件
4楼2015-07-09 08:22:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见