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hgschen

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 游侠892 at 2015-07-07 14:43:01
只要有变异,一般使用碱基错配的方式可以开发出标记。

关键是,具体该怎么操作?我多问问吧
11楼2015-07-07 15:09:32
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
10楼: Originally posted by hgschen at 2015-07-07 15:07:51
这是我用DNAMAN查找限制酶后截的图,好像确实没有对应的酶……希望不是我DNAMAN用错了……

限制性内切酶.jpg
...

具体哪个碱基发生了什么样的变化?
12楼2015-07-07 17:32:59
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hgschen

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
12楼: Originally posted by stone2239 at 2015-07-07 17:32:59
具体哪个碱基发生了什么样的变化?...

就是那个红色箭头指的碱基,另外我从文献截的图,野生型的以第三个为准。还有,能有你的QQ或其他什么联系方式么,以方便交流?谢谢了。
若两同源基因仅有一个碱基不同,有相关的分子标记技术将其区分开么?
区别.JPG


若两同源基因仅有一个碱基不同,有相关的分子标记技术将其区分开么?-1
限制性内切酶.jpg

13楼2015-07-07 19:57:29
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

的确没有酶切位点变化,那就按dCAPS的方法做。
14楼2015-07-07 21:05:29
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游侠892

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by hgschen at 2015-07-07 15:09:32
关键是,具体该怎么操作?我多问问吧...

推荐你看一下“用等位基因特异PCR检测普通小麦的单核苷酸多态性”这篇文章你就可以知道怎么做了。
路漫漫其修远兮,吾将上下而求索
15楼2015-07-08 09:53:47
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hgschen

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
14楼: Originally posted by stone2239 at 2015-07-07 21:05:29
的确没有酶切位点变化,那就按dCAPS的方法做。

额,结果就是这样,所以,这大概是什么意思呢?
若两同源基因仅有一个碱基不同,有相关的分子标记技术将其区分开么?-2
dCAPS部分结果.png

16楼2015-07-08 16:17:06
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hgschen

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
14楼: Originally posted by stone2239 at 2015-07-07 21:05:29
的确没有酶切位点变化,那就按dCAPS的方法做。

问一下,那个dCAPS就是在引物上设酶切位点,但切下来也就20bp多点吧,产物一般400~1000多,缺了20bp,条带会有明显差异么?
17楼2015-07-12 17:05:24
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


hgschen(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-14 22:47:31
引用回帖:
17楼: Originally posted by hgschen at 2015-07-12 17:05:24
问一下,那个dCAPS就是在引物上设酶切位点,但切下来也就20bp多点吧,产物一般400~1000多,缺了20bp,条带会有明显差异么?...

dCAPS引物可以设计长点,40bp左右,产物长度200-300即可,酶切后用3-4%的胶跑电泳,多跑一会,是可以区分开的。
18楼2015-07-12 17:53:37
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hgschen

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
18楼: Originally posted by stone2239 at 2015-07-12 17:53:37
dCAPS引物可以设计长点,40bp左右,产物长度200-300即可,酶切后用3-4%的胶跑电泳,多跑一会,是可以区分开的。...

我用prime premier 5设计对应的引物,发现分值都比较低,有什么解决方法么?
19楼2015-07-14 10:36:03
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
19楼: Originally posted by hgschen at 2015-07-14 10:36:03
我用prime premier 5设计对应的引物,发现分值都比较低,有什么解决方法么?...

不用管那些,用dCAPS在线工具直接设计。
20楼2015-07-14 12:18:04
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