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hgschen

新虫 (初入文坛)

[求助] 若两同源基因仅有一个碱基不同,有相关的分子标记技术将其区分开么? 已有3人参与

水稻两系不育系和恢复系中一段关键基因,仅其中一个碱基突变,在该位点形成终止密码子而不能表达,构成不育性状。现师兄想让我通过设计分子标记来区分不育系和恢复系,请问有可能么?应该怎么做?
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hgschen

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by stone2239 at 2015-07-06 17:03:47
你这个就相当于SNP标记,能检测SNP标记的方法都能用。SSCP标记技术也可以。

谢了,主要是我是第一次接触分子标记,师兄对这个了解的也不多……
7楼2015-07-06 23:37:11
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-12 23:17:42
DNA水平和RNA水平貌似都有些难度,我觉得还是在蛋白水平检测吧,用那个终止密码子后面的蛋白区段做抗体,做western检测。
2楼2015-07-06 11:38:39
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-07-12 23:17:27
可以做,如果单碱基变化产生了酶切位点变化,可以用“PCR+酶切”方法区分。
如果单碱基变化没有产生酶切位点变化,可以使用dCAPS Finder2设计引物,人为的使PCR产物中带酶切位点,然后扩出序列后也是做酶切。
3楼2015-07-06 17:00:06
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


hgschen(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-14 22:47:07
你这个就相当于SNP标记,能检测SNP标记的方法都能用。SSCP标记技术也可以。
4楼2015-07-06 17:03:47
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