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ct_kaoyan金虫 (小有名气)
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找一个互变异构反应过渡态结构 已有1人参与
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我现要要计算下面反应的过渡态，我分别用TS，QST2和QST3方法找过渡态。找到两种过渡态ts1和ts2，不不知道正确与否，ts1用gview查看负虚频震动方向是H原子在20号碳原子和21号氧原子之间震动，如下图ts1；ts2是用gview查看负虚频震动方向氢原子在20号碳原子和8号碳原子之间震动，如下图ts2。请问哪种正确？或者两种都不正确，正确的过渡态的氢原子是不是应该在碳8和氧21之间震动？请有经验的量化高手解答，非常感谢！！ 反应.png  ts1.png  ts2.png |
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ct_kaoyan
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2楼2015-07-03 21:18:58
【答案】应助回帖
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两个看起来都似乎是反应路径中的一环，所以可以试试以下几步： 1）如果ts1和ts2各自虚频都正常（有且仅有一负），可以各做irc，看看是不是ts1的反应物向和ts2的生成物向有结构一致。如果有，那就是中间态了。 2）如果irc找不到一致性，或者说很可能没有中间态，则ts1对／ts2对／ts1,2都不对。 3）假设ts1和ts2有一个正确，只要比较能量取高即可。 4）都不对也有可能？那就需要柔性扫描了，扫H和8号C的距离，或者扫H和O的距离，应该都可以。有条件也可以尝试二维柔性扫描。 |
3楼2015-07-05 00:17:57
ct_kaoyan
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6楼2015-07-08 22:53:05
ct_kaoyan
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7楼2015-07-13 20:35:54