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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » IRC计算得到的过渡态能量比优化的过渡态能量低正常码？
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hongsemenghuan

木虫 (著名写手)

[求助] IRC计算得到的过渡态能量比优化的过渡态能量低正常码？ 已有2人参与

各位，我找到的过渡态能量为-824.328930；用同样的方法和机组对此过渡态做IRC，看到了它连接的反应物和产物，但是IRC给出的过渡态（能量最高点）能量为-824.392***。这两个能量值差了39kcal/mol，IRC上的反应物和产物也比优化出来的能量要低。这说明做的IRC对不对？该怎么解决这个问题？
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1楼 2015-06-28 18:08:24
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oinkmasta

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hongsemenghuan: 金币+5, thanks 2015-07-04 15:56:20
gmy1990: 金币+2, 感谢应助 2015-07-07 03:55:00
39kcal/mol 如果不是超大体系的话，实在相差太多了。irc出来的构型和过渡态应该也不一样了。建议读过渡态算freq，然后读freq算irc。

另附Gaussian 09 IRC页面提到的：
IRC calculations require initial force constants to proceed. You must provide these to the calculation in some way. The usual method is to save the checkpoint file from the preceding frequency calculation (used to verify that the optimized geometry to be used in the IRC calculation is in fact a transition state), and then specify the RCFC option in the route section.
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16届本科在北美
8楼2015-06-30 04:07:25
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lhjms

至尊木虫 (职业作家)
电子相关能过渡态必须比两端高，吉布斯自由能可以略低，但是不宜超过3kcal/mol, 楼主这种情况应该是错了。建议贴出输入文件
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六欲痴缠，方唯何断？
3楼2015-06-29 00:27:28
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hongsemenghuan

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lhjms at 2015-06-29 00:27:28
电子相关能过渡态必须比两端高，吉布斯自由能可以略低，但是不宜超过3kcal/mol, 楼主这种情况应该是错了。建议贴出输入文件

#p irc=(calcfc,stepsize=3,maxpoint=100,maxcyc=1000) ub3lyp/6-311+g** scrf=(cpcm,solvent=Diethylether)

irc

1 1
C                 -1.31091900   -0.38172500   -0.72761500
H                 -1.71416800   -1.23856900   -1.26011200
C                  0.08361900    0.05391800   -0.98340800
H                  0.24663700    0.02876600   -2.25104900
N                 -1.95947900    0.29618000    0.14311300
N                  0.32694700    1.37724400   -0.83165500
O                 -3.23352500   -0.15063000    0.29565000
O                  1.50049600    1.65274700   -0.39622500
H                 -3.59778000    0.37958500    1.01986300
H                  1.61030600    2.62612800   -0.43580800
N                  1.16048600   -0.93746800   -0.47564900
O                  1.71181700   -1.60826200   -1.33022400
O                  1.34208200   -0.97419300    0.71820100
N                 -0.41393300   -0.01786300   -4.74946300
O                  0.61209100   -0.18688300   -3.59068600
H                  1.02822000   -1.06464200   -3.70764500
O                 -0.32962400   -0.86638300   -5.56472700
O                 -1.06596800    0.94851100   -4.59355700
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4楼2015-06-29 06:56:00
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hongsemenghuan

木虫 (著名写手)
我说的是IRC中的过渡态能量低于优化得到的能量，不是过渡态能量低于反应物和产物的能量哦。
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5楼2015-06-29 07:01:40
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